FAQ
게시판 리스트
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OmicSoft Studio를 reinstall하고 싶습니다. 조회 1259 OmicSoft Studio의 경우 MAC 주소를 통한 본사와의 연계 인증 시스템이 아니기 때문에, 기존 컴퓨터의 프로그램과 관계없이 새로운 컴퓨터에 설치하시고 라이선스를 적용하시면 됩니다.
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PetaSuite 설치 시, 관리자 권한 없이 설치할 수 있나요? 조회 1303 PetaSuite는 관리자 권한으로 설치 및 개인 사용자별 설치 모두 지원합니다. 개인 사용자별 설치 시에는, 설치 파일의 이동을 통해 원하시는 디렉토리에서 설치하실 수 있으며 삭제도 해당 디렉토리를 삭제하는 것으로 가능합니다.
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SIFT score는 어떻게 해석할까요? 조회 1358 SIFT score가 0.05 미만이면 deleterious, 그 이상이면 tolerated로 구분합니다.
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SIFT 무엇인가요? 조회 1462 SIFT (Sorting Intolerant From Tolerant)는 아미노산 변이 (AAS: amino acid substitution)가 단백질 기능에 영향을 줄 지 예측하는 알고리즘입니다. HGMD에서 disease-causing missense (DM)는 대략 80% 이며 SIFT에서 'deleterious' 로 구분됩니다. References Ng PC, Henikoff S. (2001) Predicting deleterious amino acid substitutions. Genome Res 11:863-874. Mort M, Evani US, Krishnan VG, Kamati KK, Baenziger PH, Bagchi A, Peters BJ, Sathyesh R, Li B, Sun Y, Xue B, Shah NH, Kann MG, Cooper DN, Radivojac P, Mooney SD. (2010) In silico functional profiling of human disease-associated and polymorphic amino acid substitutions. Hum Mutat 31:335-346.
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Trim 과정에서 reverse reads trim이 되질 않습니다. 조회 1256 Trim list를 만드실 때, forward, reverse 각각 1개씩 따로 만들어야 합니다. 여기서 주의할 점은 workbench는 forward, reverse 서열 모두 5` -> 3` 방향으로 로드가 되기 때문에 trim list를 만드실 때 forward, reverse 둘 다 앞쪽에서 잘라주는 방식으로 만들어야 합니다. 이렇게 각각 1개씩 trim list를 만드셨다면, 두 list를 하나의 파일로 저장해서 사용하시면 됩니다.
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