FAQ
게시판 리스트
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Search for Sequences at NCBI에서 다음과 같은 에러가 났을 때의 해결 방안을 알려주세요. 조회 1785 상단과 같은 에러가 발생하는 원인은 현재 사용하시고 계시는 곳에서 프록시 서버를 통해 인터넷에 접속하는 방식이기 때문입니다. 따라서 해당 망의 프록시 서버 정보를 기관의 전산팀에 문의하신 후 CLC Main Workbench에 기입하여야 합니다. 기입 방법 1. 현재 실행하고 계신 CLC Main Workbench를 종료하신 후 관리자 권한으로 실행해주세요. 2. 상단의 Edit > Preferences를 클릭해주세요. 3. 아래 그림의 네모칸에 Host 정보와 포트정보를 기입하시고 Ok를 누르신 후, CLC Main Workbench를 재시작해주세요. 4. 사용하시고자 하는 tool이 정상적으로 작동하는지 확인해주세요.
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HGMD online 의 검색옵션은 어떻게 되나요? 조회 1416 5가지 방식의 검색 옵션을 활용하실 수 있습니다 1. Gene symbol search - official HUGO Gene Nomenclature Committee gene symbol 기반으로 검색합니다. 2. Gene description search - Nomenclature Committee 기반으로 gene 검색을 합니다. 3. OMIM number search - OMIM number로 검색하실 수 있습니다. 4. GDB number search - GDB number로 검색하실 수 있습니다. 5. Disease/phenotype search -HGMD에 보고된 변이와 관련된 질병을 검색할 수 있습니다
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CLC Genomics Workbench 설치가 잘 되지 않습니다. 조회 1536 1. cmd를 관리자 권한으로 실행하세요. 2. "cd" 명령어를 사용하여 CLC Genomics Workbench 또는 CLC Main Workbench 설치 프로그램 파일이 있는 위치로 이동하세요. 3. 다음 명령어로 설치 프로그램을 실행하세요. CLCGenomicsWorkbench_21_0_3_64.exe -J-XX:UseAVX=0 (21_0_3은 버전 정보) 위 방법으로도 안될 시, 다음과 같이 진행하세요. 1. C:\temp 폴더를 만드세요. 2. command line에서 다음 명령어를 실행하세요. CLCGenomicsWorkbench_21_0_3_64.exe -temp C:\temp 문제가 계속되면 Java 소프트웨어 설치 로그 파일과 함께 command line의 오류 메시지 스크린 샷을 consulting@insilicogen.com 으로 보내주세요. Java 설치 로그 파일 찾는 법은 아래 링크를 참조하세요. https://www.java.com/en/download/help/log_files.xml 보내주실 때, 다음 파일들을 보내주세요. jreMSI.log java_install.log java_install_reg.log jusched.log JavaDeployReg.log 이름에 "i4j"가 있는 기타 .log 파일
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Abundance table안의 샘플들끼리 어떤 차이가 어떻게 있는지를 확인하고 싶은데, 가능한가요? 조회 1155 네, CLC Premium Module을 구매하셨다면 가능합니다. "Microbial Genomics Module | Metagenomics | Abundance Analysis | Differential Abundance Analysis" tool을 이용하여 그룹간 비교 가능합니다. 비교를 어떤 방식으로 하실지 (Across groups, All group pairs, Against control group)는 연구자 재량에 맞게 선택하시면 됩니다.
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OTU table에 metadata를 입혀 그룹별로 데이터를 확인하고 싶습니다. metadata를 어떻게 입히나요? 조회 1601 "Microbial Genomics Module | Metagenomics | Abundance Analysis | Add Metadata to Abundance Table" tool을 이용하여 metadata를 입힐 수 있습니다. 인풋은 OTU table이며, metadata는 엑셀 포맷으로 작성하시되, 첫 번째 column은 샘플 이름, 그 다음 column부터는 데이터 성격에 따라 채워주시면 됩니다. (Workbench내에 있는 샘플 이름과 metadata 샘플 이름은 동일해야 합니다.)
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