FAQ
게시판 리스트
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Core analysis 전 dataset setting에서 Subcellular location(membrane, nuclear 등)을 필터링하여 분석할 수 있나요? 조회 1,180 Core analysis 이전 단계에서 데이터를 필터링하여 분석을 진행하는 것은 어렵지만, 다음과 같은 대안 방법을 안내해 드릴 수 있습니다.1) 먼저, 분석하고자 하는 데이터세트의 컷오프 세팅 및 필터링을 하지 않고, Core analysis를 running 합니다.2) Molecules tab에서 Symbol을 All pages로 변경합니다.3) 관심 있는 Subcellular location을 필터링합니다. (예: Plasma Membrane)4) Molecules를 전체 선택(Ctrl + A)하고, Create Dataset을 클릭합니다.5) Dataset Upload 창이 나타나고, 새로운 데이터세트로 저장할 수 있습니다.이후 필터링된 Subcellular location molecules에 한해서 Core analysis를 running 할 수 있습니다.
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IPA의 Network에서 우리의 실험값 수치를 추가할 수 있나요? 조회 1,169 Network에 매칭되는 측정값이 존재하는 경우, 측정값(Log Ratio, p-value)을 추가할 수 있습니다.1) Network tab에서 관심 있는 Network을 선택한 후, View Networks를 합니다.2) Overlay > Analyses, Datasets & Lists를 클릭해 주세요.3) 아래와 같이 화면이 나타나고, 아래로 스크롤을 내리면 Graph overlay options에서 Show value 체크박스를 선택해 원하시는 측정값을 Network 상에 추가할 수 있습니다.
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Plug-in을 인터넷 없이 어떻게 설치할 수 있나요? 조회 1,763 CLC Genomics Workbench에서는 다양한 연구 분야에 적용할 수 있는 분석 도구를 제공하기 위해 Plug-in 기능을 지원합니다. Plug-in을 다운로드하는 방법은 두 가지가 있습니다.첫 번째 방법 : 인터넷 연결이 가능한 경우1. CLC Genomics Workbench 실행 후, 우측 상단의 Plug-in 아이콘을 클릭합니다.2. 'Download Plugins'를 선택한 후, 설치하려는 Plug-in을 다운로드합니다.두 번째 방법 : 인터넷 연결이 불가능한 경우1. 다음의 링크에 접속합니다. (Plug-in 다운로드)2. 원하는 Plug-in을 다운로드합니다. 이 파일은 '.cpa' 확장자로 제공됩니다.3. 다운로드한 파일을 외장 하드 드라이브나 USB를 통해 설치할 PC로 이동 시킵니다.4. CLC Genomics Workbench에서 Plug-in 아이콘을 클릭한 후, 'Install from File'을 선택합니다.5. 다운로드 받으신 '.cpa' 파일을 선택하여 설치를 완료합니다. ※ NotePlug-in 설치 후, CLC Genomics Workbench를 재시작 해야 사용 가능합니다.CLC Genomics Workbench를 '관리자 권한으로 실행'하여 설치를 진행해야 문제가 발생하지 않습니다.
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Sequencher를 실행하면 status code 35가 발생합니다. 어떻게 해결할 수 있나요? 조회 1,534 Status code 35 에러는 네트워크(Network) 라이선스에서 발생합니다.이는 KeyServer가 설치된 컴퓨터에 꽂힌 USB가 제대로 인식되지 않았을 때 발생하며, USB(동글키)가 꽂힌 컴퓨터를 재부팅하면 간단히 해결할 수 있습니다.
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BED 파일을 import 시키고 싶은데 어떻게 해야 하나요? 조회 2,415 BED (Browser Extensible Data) 파일은 유전체 상에서 특정 target region에 대한 위치 정보를 나타낸 파일입니다.BED 파일은 필수로 3개의 값(Chrom, chromStart, chromEnd)이 필요합니다.CLC Genomics Workbench 상에서 Variant Detection 분석을 수행할 때, 특정 영역에 대한 분석을 위해 BED 파일을 사용해야 합니다.다음은 CLC Genomics Workbench에서 BED 파일을 import 하는 방법입니다.먼저 CLC Genomics Workbench 시작 화면의 왼쪽 상단에 있는 Import 아이콘을 클릭한 후, 'Tracks...'를 선택합니다.그 다음 나타나는 화면에서 파일 형식을 BED 파일로 설정합니다.BED 파일 외에도 다른 파일 형식도 import 할 수 있으니 참고 바랍니다.마지막으로 Reference track을 설정하면 최종적으로 BED 파일을 CLC Genomics Workbench 상으로 불러올 수 있습니다.
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