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  • 대용량 변이 탐색(SNPs, INDEL, SV)
  • 변이 기능분석(cSNP, intergenic SNPs, synonymous/non-synonymous SNPs, etc.)
  • 집단분석(STRUCTURE, Phylogeny, FST, Pi, IBS, LD)
  • 유전형-표현형 연관분석(GWAS, Heterozygosity, ROD)
  • QTL 분석

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** FUNCTION **

주요 기능 소개

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집단 분석

  • Phylogeny tree : SNP 정보를 활용한 개체 별 유연관계
  • PCA plot : 주성분 분석을 통한 개체 간 유전적 유사성
  • LD decay plot : 개체 간 변이 변화율의 유전적 수렴도
  • Genetic structure : 집단 내 개체들의 유전적 구조
  • IBS : 개체 간 직접적인 유전적 유사도
  • FST : 집단 간 유전적 유사도(표현형1 vs 표현형2)


유전형-표현형 연관분석

  • GWAS(Genome wide association study)
  • Heterozygosity
  • ROD(Reduction of Diversity)
  • QTL 탐색
  • 표현형 원인 유전자 탐색

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적용 사례

incoVARIATION이 연구에서 어떤 역할을 하는지 확인해보세요.

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