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특화된 압축 기능을 통한 효율적인 NGS 데이터 관리
PetaSuite
PetaSuite는 NGS 데이터의 크기와 스토리지 비용을 크게 줄이는 보완
소프트웨어입니다. BAM 파일이나 gzip으로 압축된 fastq 파일을 추가 압축하여
60~90%의 압축률로 Raw FASTQ 파일 대비 96% 감소시킵니다.
또한, PetaSuite는 멀티코어를 활용하여 NGS 데이터의 압축을 수행합니다. 저장
공간을 효율적으로 활용하고 분석 속도도 가속화시켜 시간, 저장 공간, 비용을
절약해 보세요.
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- Cost savings
- Speeds up analysis
- Faster transfer
- No lock-in
- Lossless streaming compression
- NGS quality score refinement
- Transparent usage
- Easy IT deployment
- Cloud integration
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** FUNCTION **
주요 기능 소개
PetaSuite는 Public 고성능 FASTQ.gz 및 BAM 파일 압축을 통해 사용자의
스토리지 저장 공간 걱정을 덜어줍니다.
빠르고 효율적인 압축과 local 사용을 위해 제작된 파이프라인을 수정 없이
cloud에서 실행할 수 있어
NGS 연구자의 시간, 저장 공간, 비용을 절약시켜 줍니다.
** FUNCTION IMG TABLE **
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Lossless compression
- 고성능 FASTQ.gz 및 BAM 파일 압축
- 데이터 유효성 검사 및 MD5 matching
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Transparent access
- Original format의 압축 파일에 access
- 비용 대비 NGS 데이터를 효율적으로 계층화
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Choice of on-premise or cloud storage
- Object storage에서 필요한 곳으로 direct stream
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Local 사용을 위해 제작된 파이프라인을 수정 없이 cloud에서 실행
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** FUNCTION IMG TABLE END **
** FUNCTION END **
** RESEARCH-Ex **
적용 사례
PetaSuite가 연구에서 어떤 역할을 하는지 확인해보세요.
[Article]
-
Greenfield, D., Wittorff, V., & Hultner, M. (2019). The
importance of data compression in the field of genomics. IEEE
pulse, 10(2), 20-23.
-
Kaul, G., Shah, Z. A., & Abouelhoda, M. (2017, April). A high
performance storage appliance for genomic data. In International
Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (pp.
480-488). Springer, Cham.
** RESEARCH-Ex END **
** solution **
찾고 있는 솔루션이 아닌가요?
다양한 서비스가 준비되어 있습니다.
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** system **
시스템 요구사항
지원 운영체제 |
Debian / RedHat 기반 운영 체제
Windows 및 Mac용 IGV(Integrative Genomics Viewer) 지원
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** system END **
