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[뉴스레터] QIAGEN QDI 솔루션 9월호 조회 2483 2021. 09. 09 - 예정된 웨비나 OmicSoft 스튜디오 웹 세미나 QIAGEN Omicsoft Studio를 사용한 발현 데이터 분석 내용 : • 정규화된 또는 원시 카운트 데이터(전사체학, 단백질체학, 대사체학 등)를 QIAGEN OmicSoft Studio로 가져오기 • 차등 표현식 테이블, 히트맵, 카운트, PCA/PCOA 등과 같은 다운스트림 출력 생성 • 내보내기 고해상도 그래픽 및 원시 또는 필터링 된 테이블 • QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis로 결과 내보내기 • RNA-seq/scRNA-seq/microarray 데이터용으로 사용하기 쉬운 파이프라인 배포 • 공개 데이터(GEO, TCGA 등) 다운로드 또는 비교 옵션을 구현합니다. 일시 : 2021년 9월 29일 오전 3시 참가신청 : 클릭 예정된 교육 IPA 신규 사용자 2부 교육 : QIAGEN IPA를 사용한 대규모 데이터 세트 분석 및 지식 기반 쿼리 • 데이터 세트(RNA-seq, scRNA-seq, proteomics, metabolomics 등)를 업로드하고 IPA에서 대화형 코어/경로 분석 수행 • 생성된 다양한 결과 유형 이해(경로, 주요 조절자, 생물학적 기능/질병에 대한 영향 등) • 다양한 실험 조건(치료, 시점, 단일 세포 클러스터, 질병 유형 등)을 비교하고 유사점 및 대조 식별 • 가설 생성을 위한 데이터 세트 또는 실험 설계 없이도 네트워크 생성 일시 : 9월 8일 오전 3시, 9월 21일 오후 9시 참가신청 : 클릭 IPA 심화 교육: QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis(IPA): 심층 교육 내용 • 1부 : QIAGEN IPA 코어 및 비교 분석에 대한 심층 분석 • 2부 : 사용자 데이터 없이도 QIAGEN IPA를 사용하는 방법 자세히 알아보기 일시 : 9월 22일 오후 9시 참가신청 : 클릭 Single-Cell training: QIAGEN CLC Genomics Workbench를 사용한 RNA-seq 및 Single Cell RNA-seq 데이터 분석 내용 RNA-seq 및 scRNA-seq 데이터의 경우 사용자는 다음 방법을 배웁니다. • fastq 파일, 세포 매트릭스 파일 및 메타데이터 가져오기 및 참조 다운로드 방법 • 읽기를 참조 게놈에 매핑하고 매핑된 %, knee plots 등을 표시하는 유전자 및 전사체 수 및 QC 보고서 생성 • 히트맵, 차등 발현 테이블, PCA/PCOA 플롯, t-SNE 플롯, UMAP 플롯, 도트 플롯, 벤 다이어그램 등과 같은 결과의 시각화 생성 • Annotate single-cell clusters overlain with gene expression • RNA-seq 및 scRNA-seq 워크플로우를 쉽게 커스터마이징 • 출판 품질의 그래픽, 표 및 보고서 내보내기 • QIAGEN CLC Genomics Workbench에서 직접 차등 발현 테이블을 QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis로 전송 일시 : 2021년 9월 23일 오전 3시 참가신청 : 클릭 신규 고객 성공 사례: 분자 경로를 사용하여 종양의 아킬레스건을 표적으로 오클랜드 대학의 의학 연구원인 Dr. Cristin Print가 어떻게 분자 경로가 파괴되어 암 및 기타 질병을 유발하는지 이해하기 위해 노력하는 방법을 알아보고 고급 경로 분석이 그와 그의 팀이 암 및 질병 연구에 대한 통찰력을 얻는 방법을 어떻게 변화시켰는지에 대한 그의 이야기를 탐구해보세요. Clinical Insights HGMD 웹 세미나 : HGMD Professional을 사용하여 변이 지식을 극대화하세요. 내용 - HGMD Professional의 힘을 발견하고 전 세계 실험실에서 임상 테스트 해석에 HGMD Professional을 사용하는 이유를 확인 - 온라인 인터페이스 및 다운로드 가능한 HGMD 데이터베이스 사용 방법 알아보기 일시 : 2021년 9월 9일 오후 8시 참여신청 : 클릭 HSMD 웨비나: 변이에 주석을 달고 유병률을 평가하기 위해 실제 종양 사례 및 QIAGEN 지식에서 얻은 인사이트 활용: 새로운 체세포 데이터베이스 도입 내용 - HSMD에 힘을 실어주는 콘텐츠 소스 - 연구, 분자 테스트 및 의약품 개발을 포함한 여러 응용 분야에 HSMD를 사용하고 적용하는 방법과 어떤 상황에서 HSMD에 액세스할 수 있는지 탐색 일시 : 2021년 9월 29일 오후 12시 참여신청 : 클릭 QCI 웨비나: NGS 2차 분석 워크플로를 5단계로 단순화하는 방법 - QCI 2차 분석에서 NGS 분석 파이프라인을 생성, 수정, 검증 및 실행하는 방법을 알아봅니다.> - 간단한 5단계로 전체 시퀀싱 실행을 분석하는 방법에 대한 가상 데모 - QCI Secondary Analysis가 규정 준수 관리를 단순화하고 값비싼 하드웨어, 추가 IT 리소스 및 고급 생물정보학 기술의 필요성을 최소화하는 방법 보러가기 HGMD® Professional의 2021.2 릴리스를 발표합니다. 이제 HGMD Professional의 여름 릴리스를 사용할 수 있습니다. 323,661개 이상의 전문가가 선별한 질병 유발 돌연변이를 포함하는 HGMD는 생식계열 돌연변이의 가장 크고 가장 신뢰할 수 있는 출처로 남아 있습니다. 이 새 릴리스에는 이전 릴리스보다 8,954개 더 많은 돌연변이 항목이 있습니다. 신경 장애에 대한 새로운 HGMD 애플리케이션 노트 보러가기 새로운 COSMIC 솔루션 개요 보러가기 새로운 QCI 해석 빠른 시작 안내서 보러가기

[뉴스레터] 2021년 6월 QDI Newsletter 조회 1804 2021. 06. 08 - 예정된 Webinar IPA Webinar : From data to biological insight using QIAGEN CLC Single Cell Module and QIAGEN IPA 일시 : 2021년 6월 10일 01:00 AM / 1시간 진행 주제 임신 중 조혈 과정의 복잡한 단계인 장기 발달에서 가계 혈통은 만능 조혈 모세포에서 최종 분화 세포 유형에 이르기까지 다양한 단계에서 관여합니다. 간 발달의 세포 및 분자 메커니즘을 분석하는 것은 이 중요한 장기를 구성하는 세포 유형과 그들이 하는 역할을 이해하는 데 핵심입니다. 이번 웨비나에서는 cell type clusters와 그들의 biology를 강조하기 위해 태아 간의 single-cell transcriptomes를 분석합니다. 참여 신청하기 COSMIC Webinar : COSMIC: Describing millions of somatic mutations at high resolution 일시 : 2021년 6월 15일 04:00 PM / 1시간 진행 주제 COSMIC의 소개와 hand-curated content 모든 유전자는 암에서 체세포 돌연변이의 패턴을 가지고 있으며, COSMIC은 암 유전자 인구조사에서 700개 이상의 병원성 유전자를 기능적으로 상세히 기술합니다. 표현형 및 유전형 주석은 접근 가능하고 통합 가능한 고해상도 형식으로 제공됩니다. COSMIC은 정밀 약물에 대한 저항성을 유발하는 돌연변이를 설명합니다. 암을 유발하는 돌연변이는 많은 유전적 메커니즘을 덮고 있으며, 모두 COSMIC에 설명되어 있습니다. The Cancer Mutation Census는 질병, 돌연변이 작용성에 대한 영향을 측정하기 위한 모든 돌연변이에 대한 지표를 상세히 나타냅니다. 동아시아 암 환자에게 존재하는 유도 및 활성 가능한 돌연변이를 식별하는 방법 참여 신청하기 예정된 교육 OmicSoft 및 IPA 교육 : Discovery from public oncological data using QIAGEN Omicsoft OncoLand and QIAGEN IPA 일시 : 2021년 6월 18일 03:00 AM / 1시간 30분 주제 이번 교육에서는 GEO, TCGA, CCLE 및 기타 출처의 공개 종양 데이터를 사용하여 약물 표적 및 주요 유전자뿐만 아니라 바이오 마커를 발견하고 검증하는 방법에 대해 논의합니다. QIAGEN Omicsoft OncoLand, QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis(IPA) 및 OmicSoft Land Explorer 웹 인터페이스를 사용합니다. 참여 신청하기 CLC 교육 : CLC teaching package: Incorporating NGS Analysis software into your curriculum 일시 : 2021년 6월 25일 01:00 AM / 1시간 주제 QIAGEN CLC Genomics Workbench 소프트웨어와 데이터 분석 응용 프로그램을 소개합니다. QIAGEN CLC Genomics Workbench는 RNA-seq, single-cell RNA-seq, variant calling, 후생유전학 분석, de novo assembly, genome finishing, phylogenic tree construction, metagenomic analysis, Sanger sequencing, molecular biology applications 등을 포함하여 다양한 파이프라인에 널리 사용됩니다. 참여 신청하기 Single Cell Land에 대한 새 블로그 콘텐츠를 통해 Harness the power of deeply-curated scRNA-seq data to accelerate discovery and validation을 알아보세요. 최신 결과를 검증하기 위해 고도로 선별된 single-cell(scRNA-seq) 데이터를 찾고 계신가요? 검출되지 않는 관심 있는 유전자를 찾기 위해 publication의 데이터를 처리하는 데 오랜 시간을 보낸 적이 있으신가요? single-cell portal을 사용해 보았지만 중요한 메타 데이터가 부족하다고 생각하시나요? QIAGEN OmicSoft DiseaseLand 및 OncoLand 프레임 워크를 확장하여 single-cell data를 빠르게 탐색하는 새로운 QIAGEN OmicSoft Single Cell Land가 출시되었습니다. >> 자세히 보기 SARS-CoV-2 게놈 감시 데이터 분석 확장에 대한 블로그 콘텐츠가 업데이트되었습니다. 최근, SARS-CoV-2의 돌연변이가 증가함에 따라 양성 COVID-19 샘플의 NGS를 사용하여 다양한 변종의 게놈 감시를 강화하는 것이 필수적이게 되었습니다. 이에 QIAGEN이 어떻게 도움을 줄 수 있는지 알아보세요. >> 자세히 보기 SARS-CoV-2 돌연변이 분석을 위한 워크플로우 구축에 대한 새 블로그 게시물이 있습니다. 현재 패널 데이터가 미리 구축된 솔루션에서 지원하지 않는 경우 QIAGEN CLC Genomics Workbench에서 간단한 워크 플로우를 생성하여 패널 데이터를 쉽게 분석할 수 있습니다. 자세한 내용을 보려면 여기를 클릭하세요. Clinical Insights QCI Interpret One Webinar : Advancing Personalized Oncology with Transcriptomic Profiling and Mechanistic Modeling 일시 : 2021년 6월 8일 11:00 PM 이 웨비나에서 알라크리스의 차세대 시퀀싱 데이터 분석 책임자인 모리츠 슈테는 정밀 종양학 워크플로우의 일환으로 RNA 시퀀싱 단독 또는 전체 엑솜 시퀀싱과 결합하는 이점을 이야기합니다. RNA-seq가 분자 변화를 식별하고 종양 미세 환경을 조명하는 방법에 대해 논의하는 것 외에도 Schütte 박사는 분자 데이터의 수학적 모델링이 약물 민감도를 예측할 수 있는 방법을 설명합니다. 참석하려면 여기를 클릭하세요. QIAGEN Solid Tumor Summit 2021 : 2021년 6월 29일, 30일 09:00 PM QIAGEN의 Solid Tumor Summit에 초대합니다. 이 이벤트에서는 solid tumor management 분야에 관련된 모든 사람들에게 독특한 경험을 제공할 것입니다. 여기를 클릭하여 등록하세요. 5 reasons why you should use COSMIC to identify cancer mutations 국가 기준 연구소가 HGMD Professional을 신뢰하는 이유에 대한 새로운 콘텐츠가 있습니다. HGMD가 Quality over Quantity에 초점을 맞추어 기계 학습 또는 인공 지능을 사용하는 다른 플랫폼보다 어떤 것이 뛰어난 지 확인하세요. 최근 개최했던 Every Lab Summit을 놓친 분들을 위해서 녹화 자료를 여기서 모두 볼 수 있게 해두었습니다. 이번 이벤트에서 전문가들은 소규모에서 중견 임상 진단 연구소가 대형 병원 네트워크 및 대학 센터의 동일한 속도, 전문 지식 및 신뢰를 가진 정밀 종양학을 위한 포괄적인 게놈 프로파일링 서비스를 제공하기 위해 얼마나 경쟁할 수 있는지를 보여줍니다.

[뉴스레터] QIAGEN IPA User Group Meeting 조회 1656 2021. 05. 13 - Transform proteomic data into pristine results 연구자들이 MS 및 SWATH 데이터에서 새로운 발견을 놓치지 않도록 보장하는 방법을 찾을 수 있습니다. 프로테오믹 데이터 분석 및 해석을 위한 bioinformatics 솔루션에 대한 제품 업데이트 및 교육 뿐만 아니라 전문가와의 Q & A 세션을 제공하는 2시간짜리 온라인 이벤트에 참여하세요. Why attend? QIAGEN IPA에서 기능 훈련 세션을 통해 흥미로운 새로운 기능과 데이터를 사용하는 방법을 배울 수 있습니다. QIAGEN 전문가가 답변하는 기술, 과학 및 지원에 대한 질의응답을 할 수 있습니다. 현재 QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis(IPA)를 사용하고 있든 없든, 이 회의는 여러분의 실험에서 이전보다 더 깊은 통찰력을 얻을 수 있는지에 대해 생각하도록 하는 것을 목표로 합니다. 진행 날짜 : 2021년 5월 26일 오후 2시 등록하기 : 링크

What’s new in the QIAGEN IPA Spring 2021 Release 조회 1953 2021. 04. 16 - 90,000개 이상의 Analysis Match 데이터세트 컬렉션에서 관련 분석을 쉽게 찾을 수 있습니다. 이제는 필터링 및 사용자 지정 가능한 메타데이터 열을 사용하여 보거나 오버레이 할 분석 및 데이터세트를 검색하는 것이 훨씬 쉽고 정확합니다. 프로젝트 검색에서 관심있는 키워드를 단순히 입력하신 후, 메타데이터 열 위의 필터를 사용하여 원하는 대로 결과를 좁히실 수 있습니다. Figure 1. 데이터 검색 및 분석에는 검색 및 필터링을 위한 새로운 옵션이 있습니다. 예시는 NASH의 마우스 간의 연구를 찾기 위한 검색을 보여줍니다. 강화된 세포 내 위치 찾기를 통해 생물학을 설명하세요. 단백질의 세포 내 위치는 세포에서 기능과 역할에 대한 단서를 제공할 수 있습니다. 예를 들어, 미토콘드리아에서 발견되는 단백질은 라이소좀에서 발견되는 것과는 다른 역할을 합니다. 이제 모든 네트워크 또는 경로에서 분자의 상세한 세포 내 위치를 자동으로 발견하고 주석을 달 수 있습니다. Figure 2. 세포 내 위치 정보를 표시하도록 구성된 경로 Figure 3. Figure 2의 경루에서 골지체에 국한된 단백질을 보여주는 세부 사항. 다른 애플리케이션 개선 사항 Genes and chemicals에 대한 자동 완성 기능이 개선되었습니다. Gene Views, Chem Views, Canonical Pathway Reports 등이 새로운 모양과 느낌으로 업데이트 되었습니다. Figure 4. Gene View의 새로운 모습 콘텐츠 업데이트 새로운 QIAGEN OmicSoft Single Cell Land 및 SARS-CoV-2 데이터세트는 현재 Analysis Match에서 사용할 수 있는 90,000개 이상의 데이터세트에 포함되어 있습니다. 새로운 2개의 Canonical Signaling Pathways 확장성 심근병증 신호 전달 경로 (Dilated Cardiomyopathy Signaling Pathway) NAD 신호 전달 경로(NAD Signaling Pathway) 4개의 기존 Canonical Signaling Pathways에 활동 패턴 추가 자가포식(Autophagy) T 세포 수용체 신호(T Cell Receptor Signaling) 활성 및 무반응 T 림프구에서 IL-2 발현의 조절(Regulation of IL-2 Expression in Activated and Anergic T Lymphocytes) 수지상세포 성숙(Dendritic Cell Maturation) 업데이트된 1개의 Canonical Signaling Pathway 코로나바이러스 발병기전 경로(Coronavirus Pathogenesis Pathway) 다음을 포함한 12만 개 이상의 새로운 발견 (IPA에서 총 780만 개 이상) >37,000 expert findings >39,000 protein-protein interaction findings from BioGRID >22,100 cancer mutation findings from ClinVar >12,700 findings from the Mouse Genome Database (MGD) >5600 findings from the Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) >2200 Gene Ontology findings >3600 drug-to-disease findings from ClinicalTrials.gov >3900 target-to-disease findings from ClinicalTrials.gov 273 newly mappable chemicals Figure 5. ‘Analysis Match’와 ‘Activity Plot’에서 사용할 수 있는 OmicSoft 분석 콘텐츠. QIAGEN IPA의 최신 개선사항을 더 확인하고 싶으시면 링크를 클릭하세요.