[릴리즈] OmicSoft 2020R4 릴리즈
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2021. 03. 16 - 새로운 QIAGEN OmicSoft 2020R4 릴리즈
R4 릴리즈의 핵심 사항
OncoLand와 DiseaseLand는 새로운 수백 개의 새로운 프로젝트를 추가하였습니다. Select Land의 리스트에서 관심있는 Land가 보이지 않는다면, OmicSoft Server 관리자에게 “Cloud Land Publishing function”을 체크하여 사용가능한 데이터 체크를 요청하세요.
OmicSoft GTEx, Blueprint 및 CCLE Land의 최신 버전이 릴리즈되었고, Human.B38과 OmicsoftGenCode.V33에 맵핑되었습니다. 이 Land들을 사용하여 가장 최신 데이터를 얻으세요. 추가적으로 최신 gene model에서는 TRACERx_B38_GC33(멀티오믹스 비소세포폐암, non-small cell lung cancer) 및 DLBCL_NCI_B38_GC33 (미만성 거대 B세포 림프종, diffuse large cell B cell lymphoma)을 사용하실 수 있습니다.
OncoLand 2020R4 업데이트 핵심 사항
OncoGEO와 OncoMouse에 수백 개의 새로운 프로젝트 추가
출시 예정: OmicSoftGenCode.V33으로 재처리 된 TCGA_B38
OncoGEO: 이번 릴리즈에서는 추가된 102개의 프로젝트에서 4,110개의 새로운 샘플과 1245개의 새로운 비교를 사용하실 수 있습니다. 이는 신장 투명세포암(renal clear cell carcinoma), 간세포암(hepatocellular carcinoma), 교모세포종(glioblastoma), 결장암 및 대장암(colon and colorectal cancers), 자궁경부암(cervix carcinoma), 그리고 유방암(breast carcinoma)에 초점이 맞춰져 있습니다.
Figure 1. OncoGEO 2020R4에서 새로운 종양학-초점의 샘플들에 대한 분포. Y축은 조직으로 그룹화되었고, DiseaseState에 따라 색을 입힘.
Hematology(혈액학): 이번 릴리즈에서는 다발성 골수종(multiple myeloma), 급성 골수성 백혈병(acute myeloid leukemia), 미만성 거대 B세포 림프종(diffuse large cell B cell lymphoma), 만성 림프구 백혈병(chronic lymphocytic leukemia) 등 새로운 연구와 함께 55개의 프로젝트와 함께 1922개의 샘플, 557개의 비교가 추가되었습니다.
Figure 2. Hematology 2020R4에서 새로운 혈액암-초점의 샘플들에 대한 분포. Y축은 DiseaseState로 그룹화되었고 CellType에 따라 색을 입힘.
OncoMouse: 이번 릴리즈에서는 OncoMouse_B38에 만성 림프구 백혈병(chronic lymphocytic leukemia), 골수형성이상증후군(myelodysplastic syndrome), 다발성 골수종(multiple myeloma), 맨틀세포 림프종(mantle cell lymphoma)과 관련된 새로운 연구를 통해 19개의 프로젝트에서 361개의 샘플과 121개의 비교를 추가하였습니다.
DiseaseLand 2020R4 업데이트 핵심 사항
HIV와 COVID-19가 포함된 바이러스 감염에 대한 새로운 연구
정신병적 질환, 신경퇴행 질환, 셀리악병 등에 대한 새로운 연구
출시 예정: 인간 유전체 B38, OmicSoftGenCode.V33의 HumanDisease
HumanDisease: 이번 릴리즈에서는 137개의 프로젝트로부터 7,579개의 샘플과 3,234개의 비교를 HumanDisease_B37에 추가하였습니다. 새로운 프로젝트에서 다루는 많은 질병들 중 조현병(schizophrenia), 자폐 스펙트럼 장애(autism spectrum), 조울증(bipolar), 셀리악 병(celiac disease), 당뇨병(diabetes) 등에 대한 연구를 포함하여, 특히 바이러스 감염인 COVID-19, MERS와 HIV에 대한 추가 연구에 중점을 두었습니다.
Figure 3. HumanDisease 2020R4의 새로운 질병-초점 샘플 분포. Y축은 DiseaseState로 그룹화되었고 조직에 따라 색을 입힘. 정상 및 질병 대조군은 숨긴 상태.
MouseDisease: 97개의 프로젝트로부터 4,364개의 샘플과 994개의 비교를 MouseDisease_B38에 추가하였습니다. 새로운 콘텐츠로는 알러지(allergy), 알츠하이머병(Alzheimer’s disease), 자폐 스펙트럼 장애(autism spectrum), 만성신장질환(chronic kidney disease), 이식편대숙주질환(graft-vs-host disease), 헌팅턴병(Huntington's disease), 톡소플라스마증(toxoplasmosis) 및 당뇨병(diabetes)이 있습니다.
Figure 4. MouseDisease2020R4의 새로운 질병 모델 샘플에 대한 분포. Y축은 DiseaseState로 그룹화되었고 조직에 따라 색을 입힘. 정상 및 질병 대조군은 숨긴 상태.