• [뉴스레터] QIAGEN, Family studies on brain malformation - Microbiome profiling 조회 1218 2016. 12. 29 -   뇌 기형에 대한 가계연구 Oxford Biomedical Research Center에서 QIAGEN의 Ingenuity Variant Analysis를 이용하여 가계연구에서 비정상적인 뇌 발달을 일으키는 알려지지 않은 돌연변이를 밝혀냈습니다. Ingenuity Variant Analysis는 다양한 필터를 이용하여 특정한 변이를 찾을 수 있도록 도와주는 분석도구입니다. 이러한 발견 덕분에 심한 뇌 기형을 가지고 있던 가족력이 있는 가족이 건강한 아이를 가질 수 있는 새로운 방향을 가지게 되었습니다. 현재는 뇌 기형 연구의 일환으로 20가족의 exome sequencing을 수행중입니다. >자세히보기   Microbiome 프로파일링 CLC Microbial Genomics Module이 출시되었습니다. 이 플러그인은 미생물 유전체를 위한 알고리즘과 통계분석을 시각화하여 결과를 얻을 수 있는 end-to-end 워크플로우를 제공합니다. 이 모듈에 포함된 툴로 OTU클러스터링, alpha/beta diversity 분석뿐 아니라 다양한 통계분석이 가능합니다. 이를 통해 음식이나 농작물 혹은 질병에 어떤 미생물들이 연관이 깊은지 알 수 있습니다.연구자들은 이 새로운 모듈을 가지고 환자의 건강을 확인할 수 있ㅆ는 혹은 농작물의 수확량에 차이를 일으킨다고 추정되는 미생물들을 발견하여 바이오마커처럼 사용할 수 있습니다. >자세히보기   Webinars&EventsRNA-Seq 에 관련된 웨비나가 진행예정입니다. >신청하기
  • [릴리즈] NEBION, Medicago now in GENEVESTIGATOR 조회 1174 2016. 12. 29 -  Genevestigator가 업데이트 되었습니다.             <Medicago truncatula> Medicago trunculata 가 Genevestigator 데이터베이스에 추가되었습니다.653개의 큐레이션된 샘플이며, 새로운 종으로 추가되었습니다. 다음은 추가된 샘플 컨텐츠입니다.246 Perturbations (주로 생물학적 반응, 가뭄과 염류장해, 다양한 유전적 배경)35 Anatomical parts ( 뿌리, 혹, 씨앗, 잎, 꽃, 줄기)8 Developmental stages 새로운 종으로 연구분야의 시야를 넓혀보십시오.지금, Medicago 발현 데이터를 Genevestigator로 가시화해보세요.    >>>Genevestigator 바로가기 
  • [릴리즈] Ingenuity, Ingenuity Pathway Analysis (IPA®), latest update 조회 1679 2016. 12. 29 -  The IPA 2015 Summer Release is here! 깊이 있는 RNA-Seq 데이터 분석 다가오는 2015년 여름에 Ingenuity Pathway Analysis (IPA®)는 아직 밝혀지지 않은 Regulatory networks와 중요한 regulatory molecules, 특이적으로 활성화되는 패스웨이를 규명하는 기능을 보강하였습니다. 업데이트 사항: 1) 조건특이적인 유전자나 regulators을 도출하는 것과 이를 시각화시키는 속도가 빨라졌습니다.새로운 유전자 수준의 heatmaps은 특정 패스웨이, upstream regulator, downstream disease function에서 조절되는 유전자들을 정확하게 규명하게 해줍니다.   2) New content: New findings에 컨텐츠가 추가되었습니다. 그리고 패스웨이가 업데이트 되었으며,   Ensemble버전 79와 RefSeq버전 69가 업데이트 되었습니다. 3) 새롭게 수정된 IPA® 실행파일입니다.    - Download the installer    >> 자세히 보기
  • [릴리즈] NEBION, 2015.6 latest update 조회 1181 2016. 12. 29 -   최신 업데이트 소식 전해드립니다. Human, Mouse, Rat 데이터들이 새롭게 업데이트 되었고, 아울러 새로운 플랫폼이 추가되었습니다. 새롭게 큐레이션 된 실험 샘플은 2,828개입니다. 데이터 특성은 아래 리스트를 참고하세요.  Dermatology (mainly for dermatitis, acne, rosacea)Rare diseases (mainly Wolfram syndrome, Leigh syndrome)Respiratory diseases (mainly COPD, IPF, smoking)Neurology (Autism, Tourette syndrome, Rett Syndrom)Toxicology (human and rat samples)  추가된 새로운 플랫폼은 Affymetrix Human Gene 1.0 ST Array입니다. GENEVESTIGATOR 에 로그인하여 새로운 데이터를 살펴보세요.
  • [뉴스레터] Elsevier, Pathway Studio, Webinar 소식 조회 1107 2016. 12. 29 -  Pathway Studio 소식을 전해드립니다.이번 이슈는 2015년 전반적인 웨비나 프로그램입니다. Pathway Studio를 사용하는 모든 사용자들에게 도움이 될 만한 강의로 이루어져 있습니다.   Next-generation sequencing 데이터 지원4월22일 Pathway Studio Web이 새롭게 출시되었으며, 주된 특징은 사용자들이 disease pathway, protein-protein, protein function을 통해 직접 DNA mutation을 확인할 수 있습니다.  Pathway Studio의 전반적인 설명최근 Dr.Frank White의 Pathway Studio 웨비나가 있었습니다.이 웨비나는 Pathway 분석에 특화된 솔루션의 중요한 기능들을 주로 다뤘으며, 샘플 워크플로우와 새로운 NGS 데이터 분석 기능에 대한 설명도 함께 알려줍니다.                               >> 발표 슬라이드      >> 웨비나 시청  올해 모든 웨비나를 시청할 수 있습니다.웨비나를 놓치신 분이 있다면, 다음 제공해드리는 웨비나를 다시 시청하실 수 있습니다.   ● Molecular Targets에 대한 Full 텍스트 마이닝전문가 Dr. George Jiang은 Elsevier의 텍스트 마이닝 솔루션에 대한 전반적이고 훌륭한 overview를 진행하였습니다. >> 웨비나 시청 ● 면역학과 암연구를 위한 Cell-Centered DatabaseDr. Maria Shkrob가 앞으로 Pathway Studio에 추가될 암 면역 데이터베이스에 대해서 함께 의논하였습니다. >> 웨비나 시청 ● Pathway Studio 고객들의 Next-Generation Sequence 분석 능력Dr.Virginia Heatwole은 새로운 NGS 툴의 튜토리얼을 제공해 주었습니다. 이 튜토리얼은 기존의 Pathway Studio 웹의 Mammal 데이터베이스를 사용하는 고객들에게 맞춰져 있습니다.  >> 웨비나 시청 
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