• What’s new in the QIAGEN IPA Spring 2021 Release 조회 2002 2021. 04. 16 - 90,000개 이상의 Analysis Match 데이터세트 컬렉션에서 관련 분석을 쉽게 찾을 수 있습니다. 이제는 필터링 및 사용자 지정 가능한 메타데이터 열을 사용하여 보거나 오버레이 할 분석 및 데이터세트를 검색하는 것이 훨씬 쉽고 정확합니다. 프로젝트 검색에서 관심있는 키워드를 단순히 입력하신 후, 메타데이터 열 위의 필터를 사용하여 원하는 대로 결과를 좁히실 수 있습니다. Figure 1. 데이터 검색 및 분석에는 검색 및 필터링을 위한 새로운 옵션이 있습니다. 예시는 NASH의 마우스 간의 연구를 찾기 위한 검색을 보여줍니다. 강화된 세포 내 위치 찾기를 통해 생물학을 설명하세요. 단백질의 세포 내 위치는 세포에서 기능과 역할에 대한 단서를 제공할 수 있습니다. 예를 들어, 미토콘드리아에서 발견되는 단백질은 라이소좀에서 발견되는 것과는 다른 역할을 합니다. 이제 모든 네트워크 또는 경로에서 분자의 상세한 세포 내 위치를 자동으로 발견하고 주석을 달 수 있습니다. Figure 2. 세포 내 위치 정보를 표시하도록 구성된 경로 Figure 3. Figure 2의 경루에서 골지체에 국한된 단백질을 보여주는 세부 사항. 다른 애플리케이션 개선 사항 Genes and chemicals에 대한 자동 완성 기능이 개선되었습니다. Gene Views, Chem Views, Canonical Pathway Reports 등이 새로운 모양과 느낌으로 업데이트 되었습니다. Figure 4. Gene View의 새로운 모습 콘텐츠 업데이트 새로운 QIAGEN OmicSoft Single Cell Land 및 SARS-CoV-2 데이터세트는 현재 Analysis Match에서 사용할 수 있는 90,000개 이상의 데이터세트에 포함되어 있습니다. 새로운 2개의 Canonical Signaling Pathways 확장성 심근병증 신호 전달 경로 (Dilated Cardiomyopathy Signaling Pathway) NAD 신호 전달 경로(NAD Signaling Pathway) 4개의 기존 Canonical Signaling Pathways에 활동 패턴 추가 자가포식(Autophagy) T 세포 수용체 신호(T Cell Receptor Signaling) 활성 및 무반응 T 림프구에서 IL-2 발현의 조절(Regulation of IL-2 Expression in Activated and Anergic T Lymphocytes) 수지상세포 성숙(Dendritic Cell Maturation) 업데이트된 1개의 Canonical Signaling Pathway 코로나바이러스 발병기전 경로(Coronavirus Pathogenesis Pathway) 다음을 포함한 12만 개 이상의 새로운 발견 (IPA에서 총 780만 개 이상) >37,000 expert findings >39,000 protein-protein interaction findings from BioGRID >22,100 cancer mutation findings from ClinVar >12,700 findings from the Mouse Genome Database (MGD) >5600 findings from the Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) >2200 Gene Ontology findings >3600 drug-to-disease findings from ClinicalTrials.gov >3900 target-to-disease findings from ClinicalTrials.gov 273 newly mappable chemicals Figure 5. ‘Analysis Match’와 ‘Activity Plot’에서 사용할 수 있는 OmicSoft 분석 콘텐츠.   QIAGEN IPA의 최신 개선사항을 더 확인하고 싶으시면 링크를 클릭하세요.  
  • [뉴스레터] QIAGEN QDI 솔루션 4월호 조회 1896 2021. 04. 16 - 이번 달에는 새로운 OmicSoft Single Cell 출시와 HGMD, COSMIC, QIAGEN IPA, QCI IT 및 QCI Interpret의 새로운 릴리스에 중점을 둡니다.   OmicSoft Single Cell Land Launch Single Cell RNA-seq 데이터 분석을 위한 새로운 솔루션이 있습니다. scRNA-seq 데이터를 위한 Single Cell Land는 수천 개의 정밀하게 큐레이팅 된 셀 클러스터를 생성하는 수백 개의 단일 셀 프로젝트에 접근할 수 있게 해줍니다. 또한, 70개의 메타 데이터 속성 중 하나를 사용하여 검색 가능한 수백만 개의 셀에 액세스 할 수 있습니다. 여기에서 Single Cell Land에 대해 자세히 알아보십시오.   COSMIC 및 HGMD의 새로운 릴리스 COSMIC과 HGMD 모두 새 릴리스가 있습니다. 새로운 소개 웨비나와 새로운 v.93 릴리스의 최신 업데이트에서 새로운 COSMIC 제품에 대해 자세히 알아보세요. HGMD Professional의 봄 릴리스가 현재 출시되었으며 7,341개 이상의 돌연변이 항목이 추가되었습니다. 새로운 기능에는 GRCh38.p13의 업데이트 된 참조 시퀀스, ANNOVAR 용 새 데이터 세트 및 Genome Trax의 새 버전이 포함됩니다. 자세한 내용을 보려면 여기를 클릭 하세요.   QIAGEN IPA의 새 릴리스 새로운 IPA spring release가 나왔습니다. 다음은 spring release의 몇 가지 새로운 기능입니다. Analysis Match에서 필터링, 사용자 정의 가능한 메타데이터 열 네트워크의 단백질 및 분자에 대한 새로운 세포 내 위치 정보 및 기타 많은 새로운 기능 및 콘텐츠 업데이트를 통해 관련 분석 및 데이터 세트 탐색 등 모든 새로운 기능과 업데이트에 대해 알아 보려면 여기를 클릭하십시오.   예정된 웨비나 Discovery 1. CLC Webinar : “Genome assembly evaluation and improvement of structural annotation in complex non-model organisms” 4월 13일 3:00 AM 및 4월 14일 05:00 AM. 등록 하려면 여기를 클릭 하십시오 . 2. COSMIC with QDI Webinar : “Investigation of Somatic and Germline Variants by COSMIC, HGMD and QIAGEN Databases” 4월 22일 3:00 AM 및 4월 22일 05:00 AM 등록 하려면 여기를 클릭 하십시오. 3. CLC Webinar : “Assembly and annotation of plastid genomes using QIAGEN CLC Genomics” 4월 27일 3:00 AM and 4월 28일 05:00 AM 등록 하려면 여기를 클릭 하십시오.   Upcoming Events Single-Cell Data Analysis Summit : 4월 8일 05:00 PM 및 01:00 PM에 참여하세요 . QIAGEN Digital Insights는 개별 세포 집단의 생물학과 분자 동인에 대한 통찰력을 얻을 수 있는지에 대해 제시합니다. single-cell genomics에 대한 해결책과 기술을 발견하세요!  등록하려면 여기를 클릭하십시오.   Upcoming Trainings IPA New user 2-part training : : "Large dataset analysis and knowledgebase queries using QIAGEN IPA" 4 월 7 일 및 21 일 03:00 AM 및 05:00 AM 여기서 등록하십시오. IPA deep-dive training – 2 part series : "QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA) : deep-dive training " , 4 월 8 일 03:00 AM 및 05:00 AM 등록 하려면 여기를 클릭 하십시오 . OmicSoft OncoLand Training : : "Novel discoveries utilizing public data through QIAGEN Omicsoft Lands" 4월 30일 03:00 AM 및 05:00 AM 등록 하려면 여기를 클릭 하십시오 .   Single Cell Land의 새 블로그입니다.  “Harness the power of deeply-curated scRNA-seq data to accelerate discovery and validation”을 보려면 여기를 클릭하세요..   SARS-CoV-2  genomic surveillance data analysis의 확장에 관한 블로그를 읽어보세요. SARS-CoV-2의 돌연변이가 증가함에 따라, 양성 COVID-19 샘플의 whole-genome next-generation sequencing을 사용하여 다른 변종의 게놈 감시를 강화하는 것이 필수적이게 되었습니다. 이를 QIAGEN이 어떻게 따라가는지 알아보려면 여기를 클릭하세요.   QDI 제품이 최신 연구에 사용되고 있음을 보여주는 매력적인 LinkedIn 게시물을 확인해보세요. Coronavirus Pathogenesis Pathway Poster from QIAGEN IPA Learn what new in QIAGEN CLC Genomics v 21 Wastewater surveillance of SARS-CoV-2 using QIAGEN CLC Genomics   Clinical Insights Genetics Virtual Week : 4 월 20 일부터 22 일까지 COSMIC, HGMD 및 QIAGEN 지식 기반에 대해 논의하는 QDI 전문가 패널과 함께 2 일간의 온라인 서밋에 참여하세요. 여기를 클릭해 등록합니다.   주제 : QCI Interpret One Webinar : “Rapid, evidence-based reporting of oncology NGS tests at scale”  발표자 : Beate Litzenburger, Ph.D., Global Product Director of Oncology, QIAGEN Digital Insights. 날짜 : 4월 28일 12:00am 등록하려면 여기를 클릭해주세요.            주제 : QCI Interpret One Webinar: “QCI Interpret One: Oncology variant interpretation just got more precise” 발표자 : Beate Litzenburger, Ph.D., Global Product Director of Oncology, QIAGEN Digital Insights. 날짜 : 4월 29일 05:00am 등록하려면 여기를 클릭해주세요.   QCI 해석과 QCI 해석 번역에 관한 새로운 임상 블로그 Overcoming Challenges in Variant Filtering and Prioritization : 이 기사는 NGS 데이터 분석 워크플로우 - 변형 필터링 및 우선순위화의 중요한 단계를 논의합니다.                      Using the Interactive Filter Cascade in QCI Interpret Translational : 이 기사는 QCI Interpret 번역에 대한 대화형 일련의 필터를 사용하여 데이터 세트 내의 유전자 변형을 신속하게 좁힐 수 있는 방법을 알려줍니다.이 대화형 필터 캐스케이드는 관심의 선택 기준과 당면한 연구 질문에 대한 중요성을 반영하기 위해 적용될 수 있습니다.
  • [릴리즈] What’s new in the QIAGEN IPA winter 2020 Release 조회 1925 2020. 12. 15 - Work faster and better with the Winter IPA Release 이 릴리스는 몇 가지 IPA 기능을 간소화하여 고객 요청 및 FAS 개선 사항을 처리하도록 설계되었습니다.   Improved overlay and access to networks IPA의 중요한 기능은 네트워크 또는 경로에서 여러 ‘omics datasets를 오버레이하고 시각화하는 것입니다. 이제 사용자들은 "Matching molecules"표에서 한 번에 더 많은 행을 볼 수 있으며 네트워크 또는 pathway에서 노드 막대 차트를 더 쉽게 표시할 수 있습니다. 그리고 마침내 microRNA 타겟 필터는 마우스 클릭 한 번으로 microRNA-mRNA 네트워크를 시각화하는 "Display as Network" 버튼을 포함합니다.   Enhanced search & filtering of Analysis Match analyses with added metadata  이제 OmicSoft 데이터 세트 및 분석에서 PubMed ID 및 Therapeutic Area fields를 추가하여 관련 분석을 찾고 필터링하는 더 많은 방법이 있습니다. 아래 이미지는 Analysis Match 분석 중 특정 PMID를 검색하는 것을 보여줍니다. Three new Canonical Pathways Ferroptosis Signaling Pathway Role of MAPK Signaling in Inhibiting the Pathogenesis of Influenza Role of MAPK Signaling in Promoting the Pathogenesis of Influenza Addition of activity patterns to three existing Canonical Pathways HER-2 Signaling in Breast Cancer IL-17 Signaling Role of Hypercytokinemia/hyperchemokinemia in the Pathogenesis of Influenza >104,000 new findings (bringing the total in IPA to over 7.7 million), including: ~24,000 Expert findings ~44,000 cancer mutation findings from ClinVar ~18,000 protein-protein interaction findings from BioGRID ~2,300 Gene Ontology findings  ~750 drug-to-disease findings from ClinicalTrials.gov ~600 target-to-disease findings from ClinicalTrials.gov ~31,000 protein-protein interaction findings from IntAct ~500 newly mappable chemicals >6,900 new datasets for a total of >80,000 in Analysis Match and Activity Plot 이러한 분석은 2020년 12월 14일 부터 제공됩니다. Improved experience for new and trial users with training material link on Quick Start  아래 빨간색 상자에서 강조 표시된 링크를 통해 유용한 새 리소스로 접근할 수 있습니다. 자세한 사항은 해당 페이지를 참고해 주세요.
  • [뉴스레터] QIAGEN IPA newsletter – 2020년 11월 조회 1978 2020. 11. 19 - IPA로 연구하는데 도움이 되는 최신 IPA 사용 사례, 기사, 자습서 등을 살펴보세요. 이 뉴스레터에는 다음과 같은 다양한 리소스가 있습니다.   'omics 데이터 세트의 생물학적 메커니즘에 대한 백서 바이러스 전사체 분석에 대한 on-demand 웨비나 Land Explorer에서 QIAGEN IPA를 사용하는 방법을 보여주는 짧은 튜토리얼 ...등등 READ THE NEWSLETTER - 뉴스레터 상세 내용 1. White paper: QIAGEN IPA with Analysis Match QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 및 Analysis Match를 사용한 'omics 데이터 세트의 생물학적 메커니즘 이해   2. Transcriptomic analyses of in vitro flavivirus- or coronavirus-infected cell lines in vitro flavivirus- 또는 코로나 바이러스에 감염된 세포주의 전사체 분석   3. Latest Improvements | QIAGEN IPA 중요한 업데이트의 직접 다운로드를 포함한 최신 QIAGEN IPA 제품 릴리스 정보 및 제품 개선 사항에 액세스   4. Unlock the power of ‘omics datasets with QIAGEN IPA Analysis Match QIAGEN IPA가 데이터에서 새로운 인사이트를 발견하는데 어떻게 도움이 되는지 탐색   5. [Exclusive] Coronavirus Pathway available only from QIAGEN IPA QIAGEN IPA에서만 제공되는 Coronavirus Pathogenesis Pathway와 관련된 유전자 및 생물학적 메커니즘 보기   6. QIAGEN IPA with Land Explorer tutorial collection Land Explorer에서 QIAGEN IPA를 사용하는 방법을 보여주는 짧은 튜토리얼 사용 사례를 확인하세요.   7. Elevated calprotectin and abnormal myeloid cell subsets discriminate severe from mild COVID-19 8. Webinars and Events | QIAGEN Digital Insights
  • [웨비나] IPA 사용자를 위한 QIAGEN 웨비나 개최 및 참여 신청 조회 1870 2020. 11. 10 - 이번 웨비나는 생물학적context and curated informatio을 강조하며  grant or publication 제출에 있어 실험 데이터가 있든지 없든지 가설과 통찰력을 얻을 수 있는 방법을 제시합니다. 2020. 11. 24(화) 오후 3시 : How to create hypotheses and insights when you have no data of your own 2020. 11. 26(목) 오후 3시 : How to quickly analyze and make sense of your experimental data   웨비나 주제 큐레이트 된 literature and 'omics data의 방대한 콜렉션에 대한 질문 분자가 표현형/기능과 관련되어 있는지에 대한 이해 결과를 내부 및 공공데이터와 비교함으로써 맥락화 유전자 발현 변화를 유발할 수 있는 regulators 예측 >> 웨비나 참여 신청하기 (Ctrl을 누르고 클릭해주세요)     지난 웨비나를 확인해보세요!   1. CLC GWB + IPA webinar recording Easy and fast RNA-seq analysis and interpretation: https://qiagen.showpad.com/share/TfXMLkqMWHKkUzxkLqM1R   2. IPA + OmicSoft Land Explorer webinar recording Utilize large datasets and results from independent studies to advance your research: https://qiagen.showpad.com/share/6LwCtSESTg2TrKM8H4qCz   3. CLC GWB + MGM webinar recording Microbial genomics – Metagenomics, typing and coronavirus research: https://qiagen.showpad.com/share/qgvhZvQeBK5KJRpPMs38R
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