• CLC Genomics Workbench에서 Temp 및 Reference 폴더 변경 방법을 알고싶습니다. 조회 1721 2020. 07. 30 - 따로 Temp 폴더를 설정하지 않으면, Help > About CLC Genomics Workbench > File location에서 C 드라이브 아래에 자동적으로 폴더가 생성됩니다. 이를 다른 드라이브로 옮기려면 크게 2가지 과정이 필요합니다. 아래 예시는 각 폴더를 D 드라이브에 옮기고자 할 때이므로, 필요하신 드라이브에 적용하시면 됩니다.   1. 사용하고자 하는 드라이브 바로 아래에 폴더를 생성해주세요. Temp 폴더 > CLC_TMP | Reference 폴더 > CLC_References 폴더를 생성하실 때, 꼭 드라이브 바로 아래에서 진행해주세요. 예를 들어 D 드라이브 내의 A 폴더 안에 CLC_TMP 폴더를 만들고 이를 인식시키고자 하면, Genomics Workbench 프로그램이 원하는 설정과 다르게 강제로 다른 이름의 폴더를 해당 드라이브 바로 아래에 만들어 오류가 생깁니다.   2. 사용하시는 CLC Genomics Workbench 버전에 해당하는 폴더로 들어가세요. settings 폴더가 없으신 사용자 분들은 폴더를 만들어주세요. 텍스트 편집 프로그램을 이용하여 path.properties라는 파일을 해당 경로에 만들어주세요. path.properties 내부에 들어갈 내용은 다음과 같습니다. tmpdir = D:\\CLC_TMP datadir = $home/clcdata refdir = D:\\CLC_References   여기까지 완료하셨으면, CLC Genomics Workbench를 실행합니다. 다음과 같이 2번째 항목이 바뀐 것을 확인하세요. 그리고 D 드라이브 내의 CLC_TMP와 CLC_References 폴더에 데이터가 저장되는지 확인하시면 폴더 변경과정이 모두 완료된 것입니다.
  • CLC Genomics Workbench에서 PCR bias로 인한 중복 서열을 제거할 수 있나요? 조회 1623 2020. 06. 19 - 네 가능합니다. Reseqeuncing Analysis | Remove Duplicate Mapped Reads tool을 이용하시면 PCR bias로 인한 중복 서열을 제거하실 수 있습니다.   사용하시면서 중복 서열을 더 많이 detect하여 제거하고 싶으신 경우에는 "Maximum representation of minority sequence (percent)" 옵션 값을 높여서 분석을 진행하시면 됩니다.
  • IPA Core analysis에서 중복된 유전자에 대한 표시 관련 질문입니다. 조회 1357 2020. 06. 12 - 중복된 ID의 경우는 아래 core analysis 파라미터 설정하는 부분에서 Advanced 버튼을 누르면 중복 ID의 수치를 어떻게 처리할지를 설정할 수가 있습니다. 기본적으로 발현값 중에 maxium 값으로 적용이 되고 있습니다.
  • Pathway Designer (Path Designer) 실행 시 다음과 같은 에러 창이 뜹니다. 조회 1583 2020. 06. 12 - 위와 같은 에러가 뜰 경우, 먼저 현재 설치되어 있는 IPA를 삭제해주세요. 이후 https://analysis.ingenuity.com/pa/installer/select 에서 새로 인스톨러를 다운받으신 후 설치를 진행해주세요.
  • 관심있는 유전자가 포함되어 있는 pathway만 확인할 수 있는 방법은 없는지, 이 관련 유전자를 활성화/혹은 억제 시켰을때 다른 signal들이 어떻게 바뀌는지 확인하는 방법이 궁금합니다. 조회 1544 2020. 06. 05 - 검색을 통하여 관심 유전자를 검색하여 유전자 이름을 클릭하면 Gene Detail view에서 관심 유전자가 포함된 pathway 정보가 확인이 되고 확인하고자 하는 pathway를 띄운 후, overlay 기능을 통해 MAP 를 사용하면 관심 유전자를 임의로 활성화/혹은 억제 시켰을 때 pathway 내의 molecule들이 어떻게 변화하는지 예측할 수 있습니다.  
전체 319개 중 5개 표시
  • 이전 페이지
  • 1
  • ...
  • 31
  • 32
  • 33
  • ...
  • 64
  • 다음 페이지