• Microbial Genomics Module tool 중 Amplicon-based database를 구축할 수 있는 tool이 없어졌어요. 조회 1354 2021. 02. 10 - CLC Microbial Genomics Module이 21버전으로 업그레이드 되면서 해당 tool은 "Microbial Genomics Module | Tools | Create Annotated Sequence List" tool로 합쳐졌습니다.
  • 항생제 내성, 독성 관련 유전자를 선별하는 분석을 할 수 있나요? 조회 1310 2021. 02. 10 - "Microbial Genomics Module | Databases | Drug Resistance Analysis | Download Resistance Database" tool에서 데이터베이스를 다운로드 받으신 후, "Microbial Genomics Module | Drug Resistance Analysis" 하위 tool들을 이용하여 분석을 진행하시면 됩니다.
  • QCI Interpret 에서 사용하는 변이 분류 가이드라인이 궁금합니다 조회 1280 2021. 02. 10 - Germline 변이는 ACMG guideline으로 사용하며 , Cancer 변이 판독의 기준으로는 AMP/ASCO/CAP guideline의 Tier system이 사용되고 있습니다. ACMG 는 American Colleage of Medical Genetics and Genomics (ACMG) 에서 만든 서열 변이 분류 기준으로 크게 아래 5가지 표준 분류 용어로 구분됩니다. Pathogenic, Likely pathogenic, Benign, Likely benign, Uncertain significance  AMP/ASCO/CAP Guildeline의 Tier system은 총 4가지로 Strong clinical significance, Potential clinical significance, Unknow clinical significance, Likely benigh 으로 구분됩니다.
  • HGMD 데이터베이스에서 splice site에 변이 수는 얼마나 되나요? 조회 1335 2021. 02. 09 - HGMD Professional 2020.4 기준으로 26,610 개 변이가 mRNA splicing에 영향을 주는 것으로 확인되었으며, 업데이트된 통계량은 HGMD Professional 통계 페이지에서 확인 가능합니다.
  • CLC Workbench로 trimming할 때, 주문 제작한 primer trimming은 어떻게 하나요? 조회 1380 2021. 02. 05 - 메뉴바의 New | Trim Adapter List를 클릭하시어 primer adapter list를 우선 만드셔야 합니다. 그렇게 만든 파일을 저장한 뒤, Prepare Sequencing Data | Trim Reads tool을 이용하여 adapter trim 구간에서 저장한 파일을 선택해서 trimming을 진행하시면 됩니다.
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