• Search for Sequences at NCBI에서 다음과 같은 에러가 났을 때의 해결 방안을 알려주세요. 조회 1676 2021. 02. 22 - 상단과 같은 에러가 발생하는 원인은 현재 사용하시고 계시는 곳에서 프록시 서버를 통해 인터넷에 접속하는 방식이기 때문입니다. 따라서 해당 망의 프록시 서버 정보를 기관의 전산팀에 문의하신 후 CLC Main Workbench에 기입하여야 합니다.   기입 방법 1. 현재 실행하고 계신 CLC Main Workbench를 종료하신 후 관리자 권한으로 실행해주세요. 2. 상단의 Edit > Preferences를 클릭해주세요. 3. 아래 그림의 네모칸에 Host 정보와 포트정보를 기입하시고 Ok를 누르신 후, CLC Main Workbench를 재시작해주세요. 4. 사용하시고자 하는 tool이 정상적으로 작동하는지 확인해주세요.    
  • HGMD online 의 검색옵션은 어떻게 되나요? 조회 1298 2021. 02. 19 - 5가지 방식의 검색 옵션을 활용하실 수 있습니다 1. Gene symbol search - official HUGO Gene Nomenclature Committee gene symbol 기반으로 검색합니다. 2. Gene description search - Nomenclature Committee 기반으로 gene 검색을 합니다. 3. OMIM number search - OMIM number로 검색하실 수 있습니다. 4. GDB number search - GDB number로 검색하실 수 있습니다. 5. Disease/phenotype search -HGMD에 보고된 변이와 관련된 질병을 검색할 수 있습니다
  • CLC Genomics Workbench 설치가 잘 되지 않습니다. 조회 1419 2021. 02. 19 - 1. cmd를 관리자 권한으로 실행하세요. 2. "cd" 명령어를 사용하여 CLC Genomics Workbench 또는 CLC Main Workbench 설치 프로그램 파일이 있는 위치로 이동하세요. 3. 다음 명령어로 설치 프로그램을 실행하세요. CLCGenomicsWorkbench_21_0_3_64.exe -J-XX:UseAVX=0 (21_0_3은 버전 정보) 위 방법으로도 안될 시, 다음과 같이 진행하세요. 1. C:\temp 폴더를 만드세요. 2. command line에서 다음 명령어를 실행하세요. CLCGenomicsWorkbench_21_0_3_64.exe -temp C:\temp 문제가 계속되면 Java 소프트웨어 설치 로그 파일과 함께 command line의 오류 메시지 스크린 샷을 consulting@insilicogen.com 으로 보내주세요. Java 설치 로그 파일 찾는 법은 아래 링크를 참조하세요. https://www.java.com/en/download/help/log_files.xml 보내주실 때, 다음 파일들을 보내주세요. jreMSI.log java_install.log java_install_reg.log jusched.log  JavaDeployReg.log 이름에 "i4j"가 있는 기타 .log 파일
  • Abundance table안의 샘플들끼리 어떤 차이가 어떻게 있는지를 확인하고 싶은데, 가능한가요? 조회 1050 2021. 02. 18 - 네, CLC Premium Module을 구매하셨다면 가능합니다. "Microbial Genomics Module | Metagenomics | Abundance Analysis | Differential Abundance Analysis" tool을 이용하여 그룹간 비교 가능합니다. 비교를 어떤 방식으로 하실지 (Across groups, All group pairs, Against control group)는 연구자 재량에 맞게 선택하시면 됩니다.
  • OTU table에 metadata를 입혀 그룹별로 데이터를 확인하고 싶습니다. metadata를 어떻게 입히나요? 조회 1473 2021. 02. 17 - "Microbial Genomics Module | Metagenomics | Abundance Analysis | Add Metadata to Abundance Table" tool을 이용하여 metadata를 입힐 수 있습니다. 인풋은 OTU table이며, metadata는 엑셀 포맷으로 작성하시되, 첫 번째 column은 샘플 이름, 그 다음 column부터는 데이터 성격에 따라 채워주시면 됩니다. (Workbench내에 있는 샘플 이름과 metadata 샘플 이름은 동일해야 합니다.)
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