Frequently asked questions | Insilicogen, Inc.

Mapping 결과에서 각 position별 coverage를 어떻게 export하나요? 조회 1333 2016. 12. 28 - Reference의 각 position별 coverage값을 exporting 하는데에는 2가지 방법이 있습니다. 1. Input : Read mapping tracks, stand-alone read mappings, mapping graph tracks. Descriptions : 이 export 옵션은 자세한 coverage 정보를 tab으로 구분된 텍스트 파일로 저장합니다. 툴바의 Export 메뉴 -> Mapping Coverage 선택 2. Input : Stand-alone read mappings ( read mapping track 안됨) Descriptions : 이 방법은 coverage 값 정보를 콤마로 구분한 텍스트 파일로 저장합니다. 자세한 사항은 매뉴얼을 참고해주세요.
Genetic code가 무엇인가요? 조회 1423 2016. 12. 28 - CDS prediction을 할때 각 생물별로 더 정확하게 예측하도록 예외부분을 설정해두었습니다. 샘플별 특징은 http://www.incodom.kr/Genetic_codes 이 페이지에서 확인할 수 있습니다.
Differential Expression for RNA-Seq 툴을 이용하려는데 metadata를 이용하라고 합니다. Metadata가 무엇이며 어떻게 만드나요? 조회 1531 2016. 12. 28 - Metadata는 분석하고자하는 시퀀싱데이터에 대한 추가적인 설명입니다. 엑셀을 활용하여 첫 번째 칼럼은 샘플 파일 이름을 적어주시고 두 번째 칼럼부터 샘플의 정보를 적어주시면 됩니다.
같은 파일의 결과를 다른포맷으로 함께 보고싶습니다. (variant table과 track) 한 화면으로 어떻게 볼 수 있나요? 조회 1521 2016. 12. 28 - 한 화면에서 컨트롤을 누른 상태로 아래쪽에 있는 다른 view를 클릭하시면 상하로 나뉘어 새로운 창이 열립니다. 한 파일에서 작동하므로 서로 연동되어 있습니다. Table에서 variant를 선택하면 track도 함께 움직여 variant의 위치와 mapping 양상들을 함께 확인할 수 있습니다.
에러로그를 보내려고 합니다. 에러 로그파일은 어디서 확인이 가능한가요? 조회 1600 2016. 12. 28 - On Mac OS X : Library -> Application Support -> CLC bio -> Workbench -> Settings -> %workbench name% -> %version number% On Windows 2000 and XP : C:\ -> Documents and Settings -> %username% -> Application Data -> CLC bio -> Workbench -> Settings -> %workbench name% -> %version number% On Windows Vista and Windows 7 : C:\ -> Users -> %username% -> AppData -> Roaming -> CLC bio -> Workbench -> Settings -> %workbench name% -> %version number% On Linux : $HOME ->.clcbio -> workbench -> settings -> %workbench name% -> %version number%

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