자주 묻는 질문 | (주)인실리코젠-생물정보 전문기업

OmicsBox에 서열 업로드는 어떻게 하나요? 조회 1332 2021. 03. 05 - 상단 메뉴바 "File | Load | Load Sequences | Load Fasta File (.fasta)" 를 통해 fasta 서열을 업로드하실 수 있습니다.
Mapping시 PCR amplification으로 인한 중복 read 제거는 어떻게 진행하나요? 조회 1133 2021. 03. 05 - "Resequencing Analysis | Remove Duplicate Mapped Reads" tool을 이용하여 진행하실 수 있습니다. 중요! 라이브러리 준비와 관련된 증폭 단계가 있는 경우에만 해당 tool을 권장합니다. RNA-Seq 데이터, amplicon 데이터 또는 많은 수의 read가 의도적으로 동일한 참조 위치에 있는 샘플에는 권장되지 않습니다.
HGMD에서 관련 변이에 대한 reference 정보의 출처도 확인할 수 있나요? 조회 1377 2021. 02. 26 - 네. 가능합니다 HGMD 결과에서 HGMD accession number 를 이용해서 확인하실 수 있습니다. HGMD accession 정보를 클릭하시면 관련 페이지에 Comments/notes 섹션에서 자세히 어느 부분에 관련 변이가 언급되었는지 확인하실 수 있습니다.
miRNA 분석 시 Annotation 파일 관련해서 RNA central mirbase를 어디서 받을 수 있는지 궁금합니다. 조회 1415 2021. 02. 24 - RNAcentral은 별도의 DB이므로 직접 다운로드 받아서 import 해주셔야 합니다. http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/RNAcentral/releases/16.0/id_mapping/database_mappings/mirbase.tsv 위 링크로 받으시면 됩니다. (버전은 업데이트될 수 있으니, 항시 체크해서 받아주세요.)
Assembly 이후 각 서열의 peak를 확인하고 싶습니다. 조회 1407 2021. 02. 22 - CLC Workbench에서 assembly 파일을 여신 후, 오른쪽 side panel에서 아래 이미지처럼 설정을 변경해보세요.

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