• OmicSoft에서 R의 일부 패키지를 사용 가능한 것으로 알고 있는데, 최소 버전이 궁금합니다. 조회 1404 2021. 04. 02 - OmicSoft 분석 시, R의 몇몇 패키지를 사용하여 분석을 진행하실 수 있습니다. 특히 Single Cell 분석에 관련한 tool도 일부 탑재되어 있습니다. 아래는 해당 tool과 버전입니다. 4버전에 대한 부분은 아직 언급된 바 없으며, 3.5.3 버전까지는 현재 사용가능합니다. 3.6.0 이상 버전에 대해서도 공식적으로 언급된 바는 없습니다. 패키지의 업데이트로 인해 명령어가 바뀌는 경우 진행이 어려울 수 있으며, 기존에 설치된 R에서 해당 패키지와 연관성을 가지는 패키지까지 먼저 설치하신 후 OmicSoft에서 적용하시는 것을 추천드립니다.
  • QCII에서 나온 변이 리스트 Export 방법 조회 1472 2021. 04. 02 - Variant list page 맨 우측 중간에 클라우드 모양의 다운로드 아이콘을 클릭하시면 원하시는 annotation column 을 커스터마이징 하여 다운로드 받으실 수 있습니다. *.tsv, *.csv, *.vcf, 및 IPA 포맷으로 다운로드 받으실 수 있습니다.
  • QCII에서 나온 변이 리스트를 어떻게 report 하나요? 조회 1281 2021. 04. 02 - QCII 변이 분석 결과 총 59개의 변이가 검색되었다면 각각의 변이를 리포트화 할 수 있습니다.   1) Variant Details 에서 Assessment 섹션에서 변이를 "Reportable" 로 변경. 2) Variant List에서 Use Classification을 클릭하면 Reportable 변경.
  • CLC Workbench 'Navigation Area'에 표시된 서열의 아이콘 색이 다른 이유가 무엇인가요? 조회 1336 2021. 04. 02 -   빨강색 아이콘 New_Unigene은 Nucloetide 서열을 지칭하고, 초록색 아이콘 Nwe_Unigene_translation은 Protein 서열을 지칭합니다.    
  • Genome 서열에 gff/gtf 파일 annotation을 하려고 하는데 어떻게 해야하는지 알려주세요. 조회 2004 2021. 04. 01 - 1. Plugins에서 Annotate with GFF file plugin을 다운로드 받아주세요. 2. "Classical Sequence Analysis | General Sequence Analysis | Annotate with GFF/GTF/GVF file" tool을 실행시켜주세요. 3. Input 파일에 annotation시키고 싶은 서열을 넣어주시고, GFF/GTF/GVF file을 선택해서 진행해주시면 됩니다.
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