Frequently asked questions | Insilicogen, Inc.

IPA의 Canonical Pathway에서 z-score의 기준이 무엇인가요? 조회 1667 2021. 05. 21 - Canonical Pathway에서 색깔을 나타나는 것에 대한 전반적인 내용입니다. - Canonical Pathway에서 막대에 색깔이 나타나는 것 (comparison에서 각 heatmap마다의 색깔)은 Pathway Activity Analysis라는 분석이 같이 수행된 결과 - significantly-perturbed genes / proteins / chemical 들의 발현 혹은 인산화를 기반으로 예측을 진행 z-score는 pathway activity를 기준으로 결정됩니다. - 주황색은 pathway activity의 전반적인 증가 - 파란색은 pathway activity의 전반적인 감소 - 회색은 pathway와 관련된 유전자가 4개 미만인 경우 - 흰색은 z-score가 0 또는 0에 매우 가깝거나 pathway와 관련하여 분석된 dataset에 4개 이하의 유전자가 있을 때 하기 링크를 참조하시면 더 자세한 정보를 확인하실 수 있습니다. Knowledge: Canonical Pathways for a Dataset (force.com)
IPA에서 특정 조직계의 전달 물질에 관련된 분석이 가능한가요? 조회 1443 2021. 04. 23 - IPA에서 특정 전달물질에 대한 분석을 지원하지는 않습니다. 하지만 Tissue & Cell Lines 에서 신경 관련으로 한정시키고 분석을 진행한다면 한정된 결과만 얻으실 수 있어 연구에 도움이 될 수 있습니다. 신경계를 예로 들어 아래 그림을 보신다면 이해가 빠를 것 같습니다.
IPA에서 metabolomic analysis도 제공하는 것 같은데, 혹시 이 경우에는 대사체의 어떤 것을 넣어서 진행하면 될까요? 조회 1516 2021. 04. 23 - >> Input으로 CAS Registry Number, PubChem CID, HMDB와 KEGG identifiers 를 지원합니다. >> Core Analysis 진행 시, Metabolomics Analysis를 선택하시고 분석을 진행하시면 됩니다.
IPA trial의 정확한 limit이 궁금합니다. 조회 1469 2021. 04. 16 - 2021년 4월 16일 업데이트 된 IPA trial의 limit 기준으로 안내드립니다. 최대 2번의 데이터 업로드 및 내보내기 (upload / export) 최대 5번의 core analysis
OmicSoft는 IPA와 호환되나요? 조회 1487 2021. 04. 09 - IPA 라이선스를 보유하고 계신 경우, OmicSoft에서 분석한 결과 중 IPA에 input으로 사용할 수 있는 분석 결과는 바로 업로드가 가능합니다. Integration > IPA > Upload Data를 통해서 수행하실 수 있습니다.

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