자주 묻는 질문 | (주)인실리코젠-생물정보 전문기업

CLC Genomics Workbench 에서 자신만의 workflow는 어떻게 만드나요? 조회 2587 2022. 03. 21 - 1. Workflows – New Workflow 에 접속합니다. 2. Add Elements Tool을 선택하여 CLC Genomic Workbench의 Tool들을 선별합니다. Ctrl 키를 눌러 두 개 이상의 Tool을 모두 선택할 수 있습니다. 3. 추가한 후에는 마우스로 요소를 드래그 하여 요소를 이동하고 재정렬 할 수 있습니다. 4. 출력과 입력의 결합은 입력 유형 일치를 기반으로 합니다. 예를 들어 Map Reads to Reference는 Reads Track과 Report를 생성합니다. Variant Detection은 Reads Track 을 연결 할 수 있지만 Report는 연결할 수 없습니다. 5. 원하는 데이터의 Report를 보고 싶다면 use as work output을 클릭하면 자동으로 원하는 데이터들이 출력됩니다. 6.연구자가 원하는 Workflow가 완성 되었다면 Run버튼을 누르면 사용된 Tool들이 순서대로 정렬되어 parameter를 설정하게 되고, Workflow가 실행되며 자동으로 데이터가 생성됩니다.
BLAST at NCBI tool을 이용해서 BLAST 하는데, 100%라고는 뜨는데 결과가 안나옵니다. 조회 1736 2021. 07. 15 - CLC Genomics Workbench에서 1,000,000bp 보다 sequence가 길면 BLAST at NCBI tool을 이용하실 수 없습니다.
BLAST database를 다운받으려는데 기존 경로는 용량이 작아서 경로를 바꾸고 싶은데, 어떻게 바꾸나요? 조회 1605 2021. 07. 08 - 1. BLAST | Manage BLAST Databases -> Add Location 클릭한 다음, 저장할 경로 지정 2. BLAST | Download BLAST Databases -> 추가한 경로로 선택하고 databases 다운로드 진행
CLC Workbench의 Additional Alignment 플러그인에서 MUSCLE을 사용할 때, error code 2가 뜨며 진행되지 않습니다. 조회 1345 2021. 05. 28 - MUSCLE의 경우 서드파티에서 개발하고 있는 소프트웨어로, 현재 32bit만 지원하고 있는 상태입니다. 32bit의 경우 Windows 자체의 한계로 인해 프로그램 당 최대 4GB RAM 만 사용할 수 있고, MUSCLE은 그 중에서 2GB를 한계로 가지고 있습니다. 따라서 error code 2가 뜨는 경우에는 sequence의 길이를 줄이거나, 개수를 줄이는 방향으로 진행하셔야 합니다.
Annotation 파일에서 특정 annotation만 필터링할 수 있나요? 조회 1536 2021. 05. 21 - "Filter Annotation on Name" Tool을 이용하여 원하는 annotation 리스트만 필터링 할 수 있습니다.

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