• PetaSuite에서 압축 파일에 대한 링크가 없습니다. 조회 1575 2021. 04. 09 - PetaSuite 설치 시, petalink라는 소프트웨어가 내장되어 있습니다. 해당 프로그램을 통해 원본 fastq.gz 파일이나 bam 파일 압축 후, petaSuite 압축 파일을 지원하는 tool에서 그대로 사용하실 수 있습니다. Quick Guide에서 「 LD_PRELOAD=/usr/lib/petalink.so bash 」 라는 부분이 있습니다. 해당 명령어는 일회성이기 때문에, ~/.bashrc 에 「 export LD_PRELOAD=/usr/lib/petalink.so 」 를 추가해주세요. 이후 source ~/.bashrc 를 입력하시면 계속 링크를 적용 시키실 수 있습니다.
  • OmicSoft는 IPA와 호환되나요? 조회 1511 2021. 04. 09 - IPA 라이선스를 보유하고 계신 경우, OmicSoft에서 분석한 결과 중 IPA에 input으로 사용할 수 있는 분석 결과는 바로 업로드가 가능합니다. Integration > IPA > Upload Data를 통해서 수행하실 수 있습니다.
  • Taxonomic Profiling을 진행했는데, taxonomic 분석에서 나온 균주의 sequence를 얻을 수 있는 방법을 알 수 있을까요? 조회 1283 2021. 04. 09 - "Taxonomic Profiling" tool Output options에서 'Reads matching the reference database' 옵션을 선택하고 돌리시면 원하시는 결과를 얻으실 수 있습니다.
  • Reference에 mapping한 뒤, Variant Detection을 수행하여 나온 파일에서 gene정보가 안보여요. 조회 1361 2021. 04. 09 - 결과 테이블 Overlapping annotation 컬럼에서 gene 정보를 확인하실 수 있습니다.
  • OmicSoft에서 SRA를 바로 다운로드 하고 싶습니다. 조회 1476 2021. 04. 02 - 상단의 Tools > Data > Download SRA Data (NGS)를 클릭하세요. 먼저 위의 Output folder에서 저장할 경로를 선택해주시고, 아래에 SRA ID를 적어주세요. 구분자는 엔터로 1줄에 하나의 SRA ID를 적으시면 됩니다.
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