IPA의 Pathway Activity Overlay 기능을 사용하면, 특정 Canonical Pathway가 활성화되었을 때 예상되는 활성 패턴을 Pathway 위에 표시할 수 있습니다. 이 패턴을 내 데이터셋의 실제 패턴과 비교해 보며 결과를 해석하는 데 활용할 수 있습니다.

표시 방법

1. Core Analysis 결과에서 Canonical Pathways 탭을 열고, 확인하려는 Pathway를 선택합니다.
   → Pathway 위에 내 데이터셋의 발현(또는 인산화) 패턴이 표시됩니다.
2. 상단 툴바에서 [Overlay]를 클릭한 뒤, 드롭다운 메뉴에서 Molecule Activity Predictor (MAP)를 선택합니다.
   
3. 왼쪽 패널 하단의 Canonical pathway activation 항목에서 ”Color by expected activation state”를 체크합니다.
   → Pathway가 활성화되었을 때 예상되는 패턴이 색상으로 표시됩니다. (빨간색: 활성화/증가, 초록색: 억제/감소)
   
   💡‘A’를 누르면 내 데이터셋 패턴과 예상 활성 패턴을 번갈아 전환할 수 있어, 두 패턴을 손쉽게 비교할 수 있습니다.

참고 사항

• 예상 활성 패턴은 내 데이터와 무관하게 QIAGEN 큐레이터가 Pathway 내 분자 간 인과관계를 바탕으로 미리 정의해 둔 것입니다.
• 하나의 활성 상태로 정의하기 어려운 일부 Pathway는 이 옵션을 사용할 수 없습니다.