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CLC Main Workbench 사용법 온라인 교육자료
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WebEx 재생기 : WebEx 재생기 실행파일 -> 먼저 설치하세요.
교육 내용
Features of CLC Main Workbench
- CLC Main Workbench 기능
- 기본 핵심 기능
- 인터페이스 기본 특징 (Navigation Area, Toolbox, Side Panel 등)
- Plug-ins
- 데이터 Import / Export 형식
- 생물정보학적 분석 기능 (DNA, RNA, Protein 등 분석 통합적)
- 기본 핵심 기능
Sequencing data analysis
- Sequence trimming
- De novo Assembly
- Reference Assembly
- Secondary peak 분석
- SNP 분석
Primer design
- Primer 영역 지정
- Parameter 설정
- PCR 종류에 따른 primer 디자인
- Degenerate primer 디자인
Restriction enzyme & Cloning
- 제한효소 리스트 만들기
- 제한효소 site 분석
- 전기영동 preview
- 벡터 클로닝과 맵 그리기
Alignment & Phylogenetic tree
- 단백질 서열 Alignment
- Active domain 검색
- Active domain fix point 만들기
- Phylogenetic tree 그리기
BLAST & Database search
- NCBI BLAST search
- Local DB 만들기
- Local BLAST search
General sequence analysis
- Nucleotide 분석
- Protein 분석
- RNA 구조 분석
Digital expression analysis
- Microarray 데이터 불러오기
- Quality control 분석
- DEG(Differentially expressed genes) 분석
- Annotation 테스트
오픈 자료 재 정리중.
동영상을 보시려면 아래의 WebEx 재생기를 다운로드하여 먼저 설치해주세요.
WebEx 재생기 : WebEx 재생기 실행파일
Basic tutorial
제목 |
교육내용 |
교육자료 |
동영상 |
Features of CLC Main Workbench |
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Sequencing data analysis |
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Primer design |
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Restriction enzyme & Cloning |
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Alignment/Phylogenetic tree |
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BLAST & Database Search |
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General sequence analysis |
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Digital expression analysis |
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Case study
제목 |
교육내용 |
교육자료 |
동영상 |
Identifying genetic variance related to human diabetes mellitus |
CLC Main Workbench를 이용한 당뇨병 관련 유전자 변이 검출 |
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Genetic characterization of highly pathogenic H5N1 avian influenza viruses |
CLC Main Workbench를 이용한 인플루엔자 바이러스 서열의 유전학적 특징 분석 |
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Malaria vaccine research |
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