로슈사의 Rapid Translation System (RTS 실험에 이용할 단백질 서열을 최적화하는 소프트웨어입니다.
RTS는 E. coli나 wheat germ을 이용해서 높은 수율의 단백질 발현을 얻을 수 있는 실험 방법입니다. 즉, 연구자가 필요한 단백질 서열을 E. coli에 주입하거나 벡터에 주입하여 고농도의 단백질을 얻을 수 있습니다.
ProteoExpert는 RTS 실험을 하기전에 단백질 서열을 입력하여 E. coli에서 제대로 발현되는 지를 사전에 예측하고 최대 수율을 얻을 수 있는 최적의 서열을 설계할 수 있다. 따라서 연구자는 최소의 실험 시행착오로 고수율의 단백질을 얻을 수 있다.
System Requirement
Potential Customers
- 단백질의 구조나 기능을 연구하지만 단백질 추출이 어려운 연구자
- 알려진 단백질을 대량생산하고자 하는 연구원
- 입력항목이 단백질 서열이므로 적어도 원하는 단백질의 cDNA는 확보한 연구자
What is ProteoExpert?
- a novel web-based service application allowing you to overcome protein expression problems by rational design of your gene of interest.
- a bioinformatics tool enabling users of the cell-free Rapid Translation System to maximize protein yields.
- a tool mainly designed for the optimization of eukaryotic sequences expressed in prokaryotic lysate environments.
What does ProteoExpert offer?
- a list of 10 high-yield mutational variants of your input sequence, and details how you can rapidly express them in RTS E. coli.
- a high success rate as shown by substantial increases in yield for ~90% of all low-yield proteins tested to date.
- information on physical and biochemical characteristics of your target protein, including structural and functional annotation.
