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Insilicogen Case study
표피성장인자수용체(EGFR)의 증폭과 관련이 있는 질병 찾기
How can I find diseases that are involved in the amplification of a specific gene?
표피성장인자수용체(EGFR)의 증폭과 관련이 있는 질병에는 어떠한 것들이 있을까?
보통 표피성장인자수용체(EGFR)가 증폭되었을 때 어떤 질병과 관련이 있는지 알아보기 위해서 먼저 인터넷 또는 논문 검색을 하게된다. 인터넷 또는 논문 검색을 통해 찾은 정보들은 무수히 많고 그것을 하나하나 살펴보고 정리하는 것도 만만치 않은 일이다.
그래서 표피성장인자수용체가 증폭되었을 때 생길 수 있는 질병만 선택해서 찾고 한번에 Pathway까지 그릴 수 있는 방법을 소개하고자 한다.
특정 식물의 특성과 관련있는 후보 유전자를 찾기
How can I find candidate genes related to a specific plant trait?
특정 식물의 특성과 관련이 있는 후보 유전자는 어떻게 찾을 수 있을까?
식물의 특성 중에서도 과일 단계에서 과일의 크기, 모양, 색과 같은 다양한 특성에 관련된 유전자를 찾는 방법에 대해서 알아보고자 한다.
또한 과일의 색에 영향을 주는 유전자들을 찾았다고 한다면 유전자들 중에서 영향을 많이 준 순서대로 보는 방법과 과일의 색과 유전자의 관계를 뒷받침해주는 논문의 수가 많은 순서대로 보는 방법도 함께 소개한다.
약물 대사 변경으로 조절되는 잠재적인 drug-drug interaction 확인하기
Can I identify potential drug-drug interactions mediated by alterations of drug metabolism?
Drug 대사의 변경에 의해 조절되는 잠재적인 drug-drug interactions를 확인 할 수 있는가?
항응고제로 혈액응고를 방지하기 위한 약물로 알려진 쿠마딘의 대사에 대해 알아보고자 한다.
쿠마딘(와파린)은 항응고를 하는 약제로 혈관안에서 혈전이 형성되는것을 막아주기 때문에 주로 혈전 및 색전증 치료에 쓰이고 있다.
쿠마딘은 주로 간에서 대사되는데, 간 대사효소인 CYP3A4에 의해 미량 대사된다고 알려져 있다.
PathwayStudio를 통해 쿠마딘과 CYP3A4의 관계를 알아보고 CYP3A4에 영향을 주는 약물에 대해 조사해봄으로써 durg-drug 상호작용을 확인해보고자 한다.
PTPRC → STAT6 signaling pathway 조절에 관여하는 small molecule 찾기
What small molecules are known to regulate my pathway?
PTPRC(CD45)는 세포의 활성화 신호를 억제 조절할 수 있는 역할을 하는 단백질 중 하나이다.
PTPRC(CD45)는 세포막에 위치한 protein tyrosine phosphatase의 일종으로 T세포 또는 B세포의 신호전달에 관여한다.
PTPRC(CD45) 단백질을 제거한 실험에서 JAK와 신호 전달체 및 전사 활성인자 (STAT)가 활성화된다고 알려져 있다.
이러한 PTPRC(CD45) -> STAT6 signaling pathway를 조절하는 small molecule들은 무엇이 있는지 확인해보고자 한다.
식물 리그닌화(목질화)에 대한 후보 유전자 리스트 확인하기
How can I find literature supporting a list of candidate genes related to a specific plant trait?
식물 리그닌화(목질화)에 대한 후보 유전자 리스트를 확인할 수 있는 있는가?
리그닌은 목질소라고도 하며 셀룰로오스, 헤미셀룰로오스와 더불어 식물골격 구성성분의 하나로 목재 20~30%에 달한다.
식물의 리그닌화(목질화)는 식물이 자라는 과정에서 세포막이나 중간층에 리그닌이 생겨 흡착되거나 화학적으로 결합하여 강하고 단단해지는 현상을 말한다.
일반적으로 세포의 성장에 따라 서서히 일어나지만 병태 또는 상해 조직에서는 유조직세포벽에 급속히 일어나는 경우도 있다.
목질화된 세포벽은 병원균에 의해 잘 침범되지 않기 때문에 병태조직 또는 상해조직에서의 목질화는 일종의 방어반응이라고 할 수 있다.
약물에 대해 알려진 부작용과 잠재적인 부작용 찾기
What are the known and potential side effects of my drug?
약물의 알려진 부작용과 잠재적인 부작용에는 무엇이 있는가?
후천성면역결핍증이라 불리는 에이즈는 에이즈바이러스가 몸속에 침입하여 우리몸의 면역세포를 파괴시켜 면역기능이 저하되면서 각종 감염병이나 암 등이 생겨 사망에 이르게 되는 질병이다.
에이즈를 치료하는 치료제는 역전사효소 억제제와 단백질분해효소 억제제 두 가지로 나누어지는데 오늘은 단백질 분해효소 억제제인 Ritonavir에 대해 알아보고자 한다.
Ritonavir(리토나비어)는 단백질분해 효소 억제제로 세포사의 후기 단계에서 바이러스의 부분인 단백분해를 차단하여 복제를 방해하는 약물로 혈액내의 순환하고 있는 바이러스의 숫자를 줄이고 T-cell의 숫자를 증가시키는 약물이다.
Ritonavir의 부작용으로는 오심, 구토, 설사, 구강주위부 및 말초의 감각이상, 중성지방 및 콜레스테롤의 증가 및 간효소의 증가등이 있다.
Ritonavir는 간의 cytochrome P450 효소를 강력히 억제하므로 간에서 대사되는 다른 약물과 같이 사용하여서는 안된다고 알려져 있다.
오늘은 Ritonavir에 대한 알려져 있는 부작용과 잠재적인 부작용에 대해 알아보고자 한다.
