/wiki/LabKM?action=AttachFile&do=get&target=LabkmScreenShotSemanticModel.jpg LabKMTM은 당사에서 제안하는 연구지식관리시스템으로써, 위키 기반의 정보공유기능과 연구실 지식관리기능을 통합한 웹 어플리케이션입니다. 연구실 홈페이지뿐 아니라, Web2.0 기반의 지식관리 플랫홈으로 활용이 가능합니다.

Features

일반적인 위키의 기능을 실험실 정보관리에 맞도록 확장

  • 웹환경에서 각종 정보의 입력, 편집
  • 다국어지원, 다중사용자 지원
  • 유기적으로 연계된 정보관리, 각 정보의 고유주소(permanent link) 제공
  • 실험노트등 일지형태의 문서관리
  • 고급 정보검색
  • 온라인 출판, 및 결재기능

기술문서작성 보조도구 : 더이상, MS-Word, 아래한글등의 프로그램이 필요없다. 온라인에서 바로 작성하고, 공개하고, 공유한다.

  1. 수식 : latex 문법을 이용한 각종 수학용 식, 기호 표현
  2. 차트 : gnuplot 문법을 이용한 방정식 및 데이터 차트 표현
  3. 그래프 : graphviz 의 dot 문법을 이용한 그래프 표현
  4. 다이어그램 : 각종 기술 다이어그램 표현

각종 온라인 생물정보 분석도구의 통합

  1. BLAST 검색기능
  2. ClustalW를 이용한 다중서열정렬
  3. Phylip을 이용한 Phylogenetic analysis
  4. CAP3을 이용한 Fragment assembly

랩단위의 지식정보관리를 위해 위키에 다음의 기능을 추가된다.

  • 각종 기본 포맷 문서 제공 : 레포트, 실험프로토콜, 시약관리정보, 연구프로젝트정보, 실험노트
  • 연구실 일정관리 : 일정별 중요 체크리스트 확인
  • 연구책임자의 온라인 결재기능 : 레포트 및 결재가 필요한 문서에 대해 연구책임자가 직접 결재를 하거나, 온라인 출판
  • 온라인 논문작성 기능 : 탑재된 참고문헌 관리 기능을 이용하여, 논문작성시 바로바로 참고문헌 정보를 이용하고, 최종 관리할 수 있다.

Applications

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Semantic modeling

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기술문서 작성 - 수식 편집기능

/wiki/LabKM?action=AttachFile&do=get&target=LabkmScreenShotMath.jpg

기술문서 작성 - 차트 작성기능

/wiki/LabKM?action=AttachFile&do=get&target=LabkmScreenShotSchedule.jpg

스케줄 관리기능

LabKM 구성

LabKM BASE (기본 제공 모듈)

  1. 기본 홈페이지 : 연구실 홈페이지 및 웹 게시판, 자료실

  2. 기본 위키엔진 : 국제적으로 널리 사용되는 MoinMoin을 위키의 기본엔진으로 사용, 최신업데이트 지원

  3. 연구지식정보관리용 문서 및 템플릿 : 위키 기본페이지 및 각종 문서 템플릿을 제공하여, 사용자가 쉽게 연구실 지식정보를 관리할 수 있도록 지원
  4. 고급문서 작성기능 : 수식, 차트, 다이어그램, 그래프 작성 기능. 본 기능을 통해, 일반적인 워드프로세서의 기능을 웹에서 사용하고 공유할 수 있도록 지원
  5. 참고문헌 관리기능 : 논문 및 각종 보고서 작성시 사용되는 참고문헌의 관리를 체계화하여 제공

LabKM Extensions (추가 제공 모듈, 사용자 옵션)

모듈명

기능설명

비고

Lab Management Database

실험실 정보관리용 관계형 데이터베이스로서 각종 연구원정보, 과제정보, 시약정보 등을 통합 관리하는 데이터베이스

별도 RDB 구축

Customer Relationship Management Database

각종 고객과의 상호 커뮤니케이션 및 고객관리를 위한 CRM(Customer Releationship Management) 데이터베이스

별도 RDB 구축

External Database Connection

외부 관계형 데이터베이스 연동기능 (기존에 보유하고 있는 관계형 데이터베이스가 있을 때, 이를 LabKM에서 연동하여 위키문서처럼 사용)

MySQL, Oracle, PostgreSQL, Sqlite 지원

Bioinformatics tools

각종 생물정보 분석 프로그램 내장, BLAST, EMBOSS, ClustalW, PHYLIP, CAP3

사용자정의 BLAST DB 구축 및 NCBI의 BLAST DB 로컬구축, 주1회 자동업데이트

CSMD (Customized Semantic Modeling RDB)

사용자별 연구결과의 체계적 관리를 위한 의미론적(Semantic) 데이터베이스 맞춤설계 및 구축

별도 RDB 구축

CELL Smith-Waterman

고속화 서열유사성 Smith-Waterman 분석

CLC Bio 협력

CELL HMMER

고속화 서열패턴 분석

CLC Bio 협력

CELL ClustalW

고속화 다중서열 정렬

CLC Bio 협력

CELL BLAST

고속화 서열유사성 분석

CLC Bio 협력

웹디자인 템플릿

고객환경에 맞는 웹디자인 맞춤화

웹표준 준수

시스템 유지보수

초기데이터 입력지원, 유지보수

.

System archetecture

Site examples

  1. 한국생명공학연구원 유전체연구단

  2. 서강대학교 생명화학공학연구실

  3. 해조류를 이용한 온실가스 저감 연구사업

  4. KEUICC: Korea-EU International Cooperation Center

시스템 요구사항

서버보유시

  1. CPU : 2 CPU 이상 멀티프로세서 권장
  2. OS : linux / Windows 모두 가능
  3. RAM : 1 Gbyte 이상
  4. HDD : 기본 설치시 30 Gbyte 이상, 확장모듈 설치시 최대 300 Gbyte 이상

서버를 보유하지 않은 조직을 위한, LabKM호스팅 서비스 가능

  1. 도메인 : 사용자 보유 도메인, 혹은 *.labkm.net 사용
  2. 데이터 백업 지원

LabKM (last edited 2008-05-14 13:19:16 by HyungyongKim)







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