GeneSpringGX는 유전자발현 데이터에 적합한 강력한 가시화도구와 다양한 분석 기능을 제공합니다. 일반적인 개인용 컴퓨터에서도 다양한 형태의 발현 데이터들을 표현하고 분석할 수 있습니다. 대학교, 생명공학 및 제약업계 등 광범위 분야에서 사용할 수 있게 개발되어 있으며 어떤 시료로부터 얻은 데이터라도 분석할 수 있는 유연성을 가진 프로그램입니다. GeneSpringGX는 세계에서 가장 널리 사용되어지고 있는 발현분석프로그램으로 GeneSpringGX를 이용한 분석은 이미 전세계적으로 저명한 전문 학술지들에 수 백편이 인용되어 있습니다. GeneSpringGX는 Agilent사의 GeNet과 동일한 인터페이스를 공유하여 개개인의 연구성과를 모아 대규모의 유전체 연구를 추진할 수 있는 가장 적합한 플랫폼을 제공합니다.
Features
* Agilent oligo microarray 데이터 지원 * Affymetrix microarray 데이터 지원 * GE Healthcare 발현 분석 기술 지원 * MIAME compliant vocabulary를 이용한 catalog array 데이터 분석 지원 |
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* Single 또는 two parameter ANOVA 분석 * Multiple 테스트를 통한 데이터 교정 * Fales Discovery Rate (FDR) 예측 |
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* Normalization 분석 * Fold change 분석 * Clustering 분석 * 동일 발현 패턴 분석 |
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* 2D, 3D 형태의 scatter plots 제공 * 2D dendrogram 기능 * Chromosome map과 pathway diagrams 확인 * 다양한 classification view 제공 |
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Expression data from multiple platforms
Applications
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2D/3D scatter plots, 2D dendrograms, Chromosome maps, Pathway Diagrams, Classification views 등 고객이 원하는 다양한 형태의 가시화 표현이 가능합니다. |
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각 biological pathway 상에 해당 유전자들의 발현 패턴을 삽입시켜, 특정 biological pathway에 관여하는 유전자들의 움직임을 한눈에 파악 할 수 있습니다. |
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* 사용자는 다양한 실험 파라메터에 대해서 발현 데이터의 경향을 연결시켜 다양한 통계적 분석을 수행할 수 있습니다. 즉, 여러 가지 다양한 조건들을 동시에 비교 분석할 수 있습니다. * Annotated sample information * Selected expression profile * Parameters from multiple experiments |
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* 대용량의 data이거나 local computer에서 처리하기가 힘들 경우, data분석 flow chart인 Script를 이용하여 Remote server로 server-side analysis를 할 수 있습니다. |
- Identify targets reliably and quickly
- 분산분석 (ANOVA)과 조합된 필터링 도구를 사용하여 약물처리나 실험조건에 의해 영향을 받는 유전자들을 확실하게 선별할 수 있습니다. 유전자 발현 배수를 나타내는 기준선이 scatter plot상에 표시되기 때문에 추가적인 분석을 위해서 기준선 이상 또는 이하의 유전자들을 자동으로 선택할 수 있습니다.
- Characterize novel expression patterns
GeneSpring은 유전자 발현 실험에서 의미 있는 발현 패턴들을 정교하게 표현해 주며, 이들 패턴들 간의 관계를 이해하는데 도움을 줍니다.
- Hierarchical clustering (Gene Tree/Experimental Tree)
- Self-organizing maps
- K-means clustering
- Principle component analysis (PCA)
System Requirement
Microsoft Windows
- 32bit
- Windows XP, Windows Vista, or Japanese Windows XP, Windows 7
- 1 GB RAM or higher
- 64 bit
- Windows Vista, Windows XP64 SP2, Windows 7
- 2 GB RAM or higher
- 1 GB available disk space
- 1024 x 768 display
Macintosh
- Mac OS X (Snow Leopard 10.6 and Lion 10.7)
- Mac OS X 10.4 또는 그 이하, PowerPC architecture에서는 지원 안됨
- JVM 1.5.0_05 or higher running
- 1 GB RAM or higher
- 1 GB available disk space
- 1024 x 768 display
Linux
- Red Hat Enterprise Linux 5, Debian GNU/Linux 4.0r1
- 1GB RAM or higher
- 1GB available disk space
- 1024 x 768 display
- Required run-time library: libstdc++.so.5
License
GeneSpring GX를 구매하시고자 하는 분은 저희 Codes사업부에 연락을 주시면 구매절차에 대해서 말씀드리겠습니다.
연락처 : 031)278-0061, codes@insilicogen.com
