CLC_Free_WorkbenchTM Ver.3은 생물정보학적 분석, 유연한 데이타 관리, 뛰어난 그래픽 viewing, 출력 옵션들을 사용자가 쉽게 사용할 수 있게 만든 소프트웨어입니다.
Features
- 다양한 분석 도구를 이용하여 쉽고 정확한 분석기능을 제공합니다.
- Phylogenetic Tree, ORF등 일반적인 분석기능
- Bioinformatics Cell, Cube와 연동하여 분석속도 향상
- CLC Database Solution의 도입으로 사용자간의 데이터 공유
Applications
- Free Workbench에서 제공하는 생물정보학 기능은 다음과 같습니다.
- DNA, RNA 그리고 protein 에서 두가지 방식으로 다중서열 정렬
- Consensus sequence 찾고 관리하는 기능
- 다중서열간 Conservation 점수 비교
- 자동으로 ORF(Open reading frame)를 찾기
- 웹기반의 Genbank접속을 통해 DNA와 Protein 검색을 물론, 필요에 따라 다운로드를 하거나 그래픽한 환경으로 서열정보 열람
- 각종 genetic translation 테이블을 통해서 DNA로부터 Protein을 생성해냄
- 단백질의 경우 아미노산 구성, 분자량, iso electric point 정보 조회
- 다중서열 정렬시 Neighbor-joining 이나 UPGMA 알고리즘 이용
- 제한효소 위치 분석 및 보기
- Reverse complement 서열 만들기
- 서열 섞기
- Option of viewing and graphical manipulation of bioinformatics analyses made in commercial workbenches from CLC bio
- 그외의 Free workbench 기능은 다음과 같습니다.
- 데이터 입력,관리,결과 분석 및 데이터 출력등에 관한 모든 기능이 통합됨. 결과적으로 여러 프로그램과 웹사이트를 돌아다니면서 데이터를 옮겨야 하는 번거로움이 사라지고 효율성이 증대됨.
- 프로젝트 내의 모든종류의 파일이 저장되며 프로그램을 통해 열고 작업할 수 있음.
- 자세한 히스토리 정보
- DNA, RNA and protein 서열분석시에 사용자에게 친근하고 직관적인 환경제공
- 텍스트 기반의 서열조회
- 그림을 포함한 쉬운 보고서 출력
- 사용자가 원하는 다양한 형식의 그림으로 출력 가능
- 다양한 데이터 파일 형식으로 불러들이거나 추출해 낼 수 있음.
- 동시에 다른 프로젝트의 다른 파일을 작업할 수 있음.
- 여러개의 프로젝트를 한번에 병렬작업이 가능하도록 한번에 여러개의 활성화된 워크스페이스 운영가능
System Requirement
- 하드웨어 사양
- PentiumII 512MB RAM, 1GB HDD 이상 IBM PC 호환 기종
- 또는 동급의 맥킨토쉬
- 운영 체계
- Microsoft Windows 98, NT, 2000, XP or Vista
- Mac OSX V.10.2.6 이상
