Overview
CLC RNA Workbench는 RNA 분자의 복잡한 분석을 완전하게 통합되어지고, 사용자 편의적이고, 그래픽적으로 더욱 발전된 바이오인포매틱스 프레임웤을 제공합니다.
Features
Advanced
The CLC RNA Workbench는 복잡한 여러옵션과 알고리즘을 쉽게 이용하도록 제공합니댜.
CLC RNA Workbench를 통해서 사용자들은 한가닥서열의 RNA나 2차원의 구조정보를 동시에 볼 수 있습니다. 여기에 사용되는 2차구조의 열역학적 성질등의 정보는 쉽게 찾을 수 있습니다. 그리고, 만들어진 2차구조는 보다 쉽게 볼 수 있도록 수정이 가능하며, 논문에 쉽게 인용할 수 있도록 도와줍니다.
편의성
컴퓨터를 전문적으로 다루는 능력은 필요치 않습니다.
Due to a unique graphical user interface the CLC RNA Workbench의 독보적인 그래픽환경과 사용자 인터페이스로 인해서 직관적이며 쉬운 사용환경을 제공합니다. 사용자 메뉴얼은 세부사항들까지 자세하게 설명합니다.
모든 종류의 CLC Workbench 데이터와 호환가능함으로꺼 연구자들간의 긴밀한 협업이 가능하고 이를 통해서 서열정보를 공유하거나 연구결과를 상호 참조하는등의 효율성을 높일 수 있습니다.
기능
- 최신의 최소 자유에너지 알고리즘에 입각한 RNA 2차구조 분석에는 coaxial stacking, suboptimal structures and experimental constraints등의 옵션이 있습니다.
- 향상된 기능의 그래픽 기반의 1차,2차 RNA 편집기가 내장되어 있으며 이를 통해 서열분석이나 2차구조 분석을 할 수 있습니다.
- 다양한 RNA 분석을 지원합니다. 여기에는 모티프 검색과 최신의 그래픽화면과 편집기능을 포함합니다.
- 자세한 히스토리기능을 통해서 전체적인 분석에서 변경된부분을 찾아볼 수 있으며 추적해 낼수 있습니다.
- Option of importing and working with external files such as PDF files, word processing files, and spreadsheet files directly from the program’s data repository. All types of files related to a research project can thus be managed from a single application on your computer.
- PDF나 문서편집기, 혹은 엑셀파일등을 프로그램 데이터 영역으로 불러올 수 있습니다. 그럼으로써 연구와 연관된 모든 정보가 연구자 컴퓨터에서 단 하나의 프로그램에서만 관리 됩니다.
- 데이터 관리기능이 포함되어 있으며, 생물정보분석, 결과문서, 보고문서 및 기타문서등을 지원할 수 있습니다. 이러한 기능은 손수 데이터를 옮겨서 다른 프로그램에서 분석하거나 결과를 출력하는 데 소요되는 시간과 노력을 줄일 수 있습니다.
- 여러가지의 출력지원, 프린팅을 하거나 다양한 그림포맷파일로 저장이 가능합니다.
- CLC Bioinformatics Cube 지원. The Cube는 하드웨어적으로 데이터베이스 검색을 가속시켜서 평균적인 노트북보다 약 200배 빠르고 정확하게 검색을 수행할 수 있습니다.
- CLC Developer Kit를 이용해서 자신에게 맞는 생물정보 솔루션을 개발할 수도 있습니다.
생물정보학적 기능
- CLC Free Workbench의 모든기능 .
- State of the art algortihms for free energy minimization based prediction of RNA secondary structure, including advanced options.
- Advanced and fully integrated graphical editors for linear and 2D viewing and editing of RNA secondary structures and sequences.
- RNA pattern의 검색과 발굴.
- Local complexity region 분석.
- 향상된 결과 조회 화면의 Local and web-based BLAST
- RNA, DNA and protein의 서열정보를 직선이나 환형으로 표시하여 편집.
- RNA, DNA, and protein의 다중서열정렬 수정.
- RNA, DNA and Protein 다중서열정렬의 데이터 호환.
- 향상된 편집,복사 기능을 포함하는 서열의 주석작업.
- 여러종류의 번역정보(Translation table)을 통한 Protein에서 DNA서열로 역번역(Reverse translation)
- 향상된 기능의 제한효소분석기능및 결과정보 관리
- Dot plot 기반의 분석.
- 가상 제한효소 지도.
- NCBI 서열정보 검색.
- Google 과 Pubmed등의 웹정보 검색
