CLC_RNA_WorkbenchTM Ver.3은 RNA의 이차 구조를 예측하기 위한 생물정보학 소프트웨어로서 최적의 알고리즘과 옵션을 제공하여 빠르고 편리하게 정확한 데이터를 얻으실 수 있습니다.
Features
- 다양한 분석 도구를 이용하여 쉽고 정확한 분석기능을 제공합니다.
- RNA 이차구조 예측
- RNA 이차구조의 Graphical View와 Editing 기능 제공
- Bioinformatics Cell, Cube와 연동하여 분석속도 향상
- CLC Database Solution의 도입으로 사용자간의 데이터 공유
Applications
다음과 같은 대표적인 응용뿐만 아니라 다양한 유전자 분석에 활용됩니다.
- CLC Free Workbench의 모든기능 .
- 유용한 옵션을 활용한 RNA 이차구조 예측 및 수정기능.
- RNA pattern의 검색과 발굴.
- Local complexity region 분석.
- 향상된 결과 조회 화면의 Local and web-based BLAST
- RNA, DNA and protein의 서열정보를 직선이나 환형으로 표시하여 편집.
- RNA, DNA, and protein의 다중서열정렬 수정.
- RNA, DNA and Protein 다중서열정렬의 데이터 호환.
- 향상된 편집,복사 기능을 포함하는 서열의 주석작업.
- 여러종류의 번역정보(Translation table)을 통한 Protein에서 DNA서열로 역번역(Reverse translation)
- 향상된 기능의 제한효소분석기능및 결과정보 관리
- Dot plot 기반의 분석.
- 가상 제한효소 지도.
- NCBI 서열정보 검색.
- Google 과 Pubmed등의 웹정보 검색
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* RNA Structure의 수치화 된 테이블과 display의 연동, Viewing을 통한 예측  |
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* 푸른색 원형의 Anchor Point를 중심으로 RNA 구조 Editing |
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* RNA Sequence와 2차구조의 연동, Viewing |
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* P-Optimal Value에 따른 색 표시. |
RNA이차구조예측
System Requirement
- 하드웨어 사양
- PentiumII 512MB RAM, 1GB HDD 이상 IBM PC 호환 기종
- 또는 동급의 맥킨토쉬
- 운영 체계
- Microsoft Windows 98, NT, 2000, XP or Vista, Linux
- Mac OSX V.10.2.6 이상
