Contents

  1. Main Features
  2. Detail Features
  3. Screenshot
  4. Applications
  5. System Requirement
  6. Download
  7. CaseStudy
  8. Licence
CLC Main WorkbenchTM Ver.4는 CLCbio사에서 제공하는 생물정보 소프트웨어 입니다. 복잡한 분자생물학 데이터 분석 및 관리를 위해 사용자분들에게 DNA, RNA 및 Protein등의 최신 분석기법과 효과적인 데이터관리, 최적화된 그래픽등을 제공하고 있습니다. 또한 Plug-In모듈(MLST, TMHMM등)등을 제공함으로써 최상의 맞춤형 분석을 실현하였습니다.

Main Features

아래의 각 링크를 클릭하시면 CLC Main Workbench에 대한 주요 특성들을 보실 수 있습니다.

Detail Features

  • 상세 정보 링크 : CLC Main Workbench의 각 기능에 대한 보다 상세한 정보를 보실 수 있습니다.

Screenshot

  • Primer design, BLAST search, Dotplot, UniProt search, 3D structure viewer, Multiple sequence alignments 에 대한 상세한 Screenshot을 보실 수 있습니다.

  • Screenshot 모음

Applications

  • CLC Main Workbench는 'CLC DNA Workbench', 'CLC RNA Workbench', 'CLC Protein Workbench' 를 통합한 프로그램으로 아래에 각 Workbench에 대한 간략한 기능을 보실 수 있습니다.
  • CLC Sequence Viewer
    1. DNA, RNA Protein(two algorithms)의 다중 정렬
    2. Consensus sequence 결정과 관리
    3. 정렬에 따른 Conservation score
    4. ORF(Open Reading Frame) 예측

    5. 웹을 이용하여 손쉽게 GenBank에 접속 가능하며 Protein and Nucleotide 정보검색 가능

    6. Translation 기능(all genetic translation table)
    7. 단백질에서의 residue composition, molecular weight, iso electric point 분석
    8. Neighbor-joining and UPGMA phylogenies
    9. Restriction site 분석과 보기
    10. Reverse complement 만들기
  • CLC DNA Workbench
    1. 그래픽과 알고리즘을 통한 진보된 primer design 에디터
    2. DNA sequence data의 assembly
    3. Molecular cloning
    4. SNP 주석달기 자동화
    5. Low complexity region 분석
    6. 수많은 종들의 genetic table 을 이용하여 단백질로부터 유전자로의 역번역
    7. 제한 효소 분석과 관리
    8. Dot plot 기반의 분석
    9. 주어진 분자의 수많은 특징을 포함한 DNA 통계 리포트
    10. NCBI sequence data 검색

    11. PubMed로 접속가능

  • CLC Protein Workbench
    1. 통합된 3D 뷰어
    2. Transmembrane helix prediction
    3. identify antigenic regions in protein sequences
    4. 단백질 이차 구조 예측
    5. PFAM domain search
    6. 웹 기반으로 signal peptides와 그것들의 cleavage sites의 예측(SignalP – 현존하는 가장 좋은 툴)
    7. Hydrophobicity의 분석과 그래프 제공
    8. Protein charge의 분석과 그래프 제공
    9. 단백질에서 유전자로의 역번역 (많은 번역 테이블 제공)
    10. DNA 와 RNA 그리고 protein 간의 상호작용
    11. respect to cleavage by a selection of proteolytic enzymes
  • 기타 Pattern search, Database Search, Project Managemente등의 기능들이 있습니다.

Phyrotree.jpg

{i} FreeWorkbench기능

* 다중서열 정렬시 Neighbor-joining 이나 UPGMA 알고리즘 이용
* ORF, RestrictionEnzyme Site 검색 {isg}

Primer.jpg

{i} DNAWorkbench기능

* DNA레벨의 각종 분석기능 통합
* PrimerDesign, ContigAssembly, Alignment, Translation, etc
* 각종 Web기반의 Database 검색 {isg}

RNAStructure.jpg

{i} RNAWorkbench기능

* RNA레벨의 각종 분석기능통합
* RNA 이차구조 예측 및 수정
* RNA 패턴검색 {isg}

ProteinStructure.jpg

{i} ProteinWorkbench기능

* Protein 레벨의 각종 분석기능 통합
* Trnasmembrane 구조예측
* Protein 3차구조 Viewing, Editing
* Protein의 물리화학적 특성제시 {isg}

System Requirement

  • 하드웨어 사양
    • PentiumII 512MB RAM, 1GB HDD 이상 IBM PC 호환 기종
    • 또는 동급의 맥킨토쉬
  • 운영 체계
    • Microsoft Windows 98, NT, 2000, XP or Vista
    • Mac OSX V.10.2.6 이상

Download

CaseStudy

아래 PDF파일은 CLC Workbench제품을 실제 연구에 활용한 사례를 문서로 작성한 것입니다.

Licence

  • CLC Combined Workbench를 구매하시고자 하는 분은 상단의 '견적의뢰'를 작성하시거나 직접 저희에게 연락을 주시면 구매절차에 대해서 말씀드리겠습니다.

  • 무료로 일정기간 사용하시고자 하는 분은 Trial Download 페이지에 접속하셔서 관련 정보를 기입하신 후 다운로드 받아 사용하실 수 있습니다.

CategoryProduct

CLC Main Workbench (last edited 2008-09-19 10:49:14 by 강병철)







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