Gene name, Disease, Compound와의 상관관계 이용
Overview
BioLT는 문헌정보를 추출하는 시스템으로 주로 MEDLINE 데이타베이스로부터 정보를 수집한다. 고전적인 정보 복구 시스템과는 대조적으로, BioLT는 이미 특별한 도메인에 대한 지식을 포함하고 있다. BioLT는 규격화되고 기초가 되는 내용을 요약하기 위해서 특별한 배경 지식을 사용하여 특정 본문 데이타베이스를 미리 분석한다. BioLT의 검색 결과는 쉽게 공유되어지고 확장가능하며, 손쉽게 업데이트되어 질 수 있다. 이를 바탕으로 BioLT는 새로운 지식과 가설의 정제와 도입을 위한 시작점을 제공한다. BioLT는 복잡하고 전혀 다른 성격의 데이타베이스들로부터 연구자가 원하는 정보를 얻기 위해 새롭게 개발되어질 수 있다. 예를들어, 화합물과 질환 관계를 포함하는 모든 인간의 암과 연관된 유전자들의 최신 목록을 만들어 내기 위한 US National Cancer Institute(NCI)와 함께한 프로젝트에서 BioLT는 자동적인 테이터 수집 구성을 위해 중심적으로 사용되고 있다.
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Function
- 생물학적인 연구와 특정 의학 분야를 위한 솔루션을 제공
- Polymorphism이나 signal transduction pathways 같은 특별한 도메인 지식을 해석
- 모든 MEDLINE 정보를 포함 (~12,000,000)
- 확장된 유전자 이름 사전 (variants를 포한한 260,000 Human Gene Names)
- 단어 의미를 명확하게 하기 위한 평이한 영어 사전 (140,000)
- 특별한 생물 의학 사전 (16,000)
- 큰 질환 사전들 (130,000)
- 화합물들 (71,000)
- Sub domain (tissue, cell, etc.)을 위한 많은 추가적인 사전들
Biomolecular Domain Filter & Medical Domain Filter
- Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)를 위한 인식자
Gene-Gene Relations (>3,000,000)
Gene-Disease Relations (>1,500,000)
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